在闪亮中获取对象未找到错误

Question

library(shiny)
library(shinydashboard)
library(leaflet)
library(data.table)
library(ggplot2)
library(usl)

ui <- pageWithSidebar(
  headerPanel("CSV Viewer"),
  sidebarPanel(
    fileInput('file1', 'Choose CSV File',
              accept=c('text/csv','text/comma-separated-values,text/plain','.csv')),
    tags$hr(),
    checkboxInput('header', 'Header', TRUE),
    fluidRow(
      column(6,radioButtons("xaxisGrp","X-Axis:", c("1"="1","2"="2"))),
      column(6,checkboxGroupInput("yaxisGrp","Y-axis:", c("1"="1","2"="2")))
    ),
    radioButtons('sep', 'Separator',
                 c(Comma=',', Semicolon=';',Tab='\t'), ','),
    radioButtons('quote', 'Quote',
                 c(None='','Double Quote'='"','Single Quote'="'"),'"'),
    uiOutput("choose_columns")
  ),
  mainPanel(
    tabsetPanel(
      tabPanel("Data", tableOutput('contents')),
      tabPanel("Plot",plotOutput("plot")),
      tabPanel("Summary",uiOutput("summary"))

    )
  )
)


####server

server <- function(input, output,session) {
  dsnames <- c()
  u<-
  data_set <- reactive({
    inFile <- input$file1
    data(specsdm91)
    if (is.null(inFile))
      return(specsdm91)

    data_set<-read.csv(inFile$datapath, header=input$header, 
                       sep=input$sep, quote=input$quote)
  })

  output$contents <- renderTable({data_set()})

  observe({
    dsnames <- names(data_set())
    cb_options <- list()
    cb_options[ dsnames] <- dsnames
    updateRadioButtons(session, "xaxisGrp",
                       label = "X-Axis",
                       choices = cb_options,
                       selected = "")
    updateCheckboxGroupInput(session, "yaxisGrp",
                             label = "Y-Axis",
                             choices = cb_options,
                             selected = "")
  })
  output$choose_dataset <- renderUI({
    selectInput("dataset", "Data set", as.list(data_sets))
  })

  usl.model <- reactive({

      df <- data_set()
     # print(df)
      df2 <- df[,c(input$xaxisGrp, input$yaxisGrp)]

      #gp <- NULL
      if (!is.null(df)){

        xv <- input$xaxisGrp
        yv <- input$yaxisGrp
        print(xv)
        print(yv)
        if (!is.null(xv) & !is.null(yv)){

          if (sum(xv %in% names(df))>0){ # supress error when changing files

            usl.model <- usl(as.formula(paste(yv, '~', xv)), data = df)
           return(usl.model())

          }
        }
      }
      #return(gp)
    }
  )


  ##plot
  output$plot = renderPlot({

   plot(usl.model())

  } )

  ##
 # output$summary <- renderUI({

  #  summary(usl.model())

  #}) 

  ##

  output$choose_columns <- renderUI({

    if(is.null(input$dataset))
      return()
    colnames <- names(contents)
    checkboxGroupInput("columns", "Choose columns", 
                       choices  = colnames,
                       selected = colnames)
  }) 
}
shinyApp(ui, server)

如您所见，我打印了 df。有什么想法吗？

Answer 1

编辑：请给出一个可重现的数据示例。没有它，很难想象数据类型是什么。总的来说，我认为你可能有两个问题：

1. 什么是gp？您需要返回的不是gp，而是usl.model
2. 您的 renderUI 没有传递 UI 对象（即，输出函数不知道如何处理）。

---

您的问题是usl.model 实际上并没有保存在任何地方，因为它在renderPlot 中被调用，它只返回情节。由于您希望 usl.model 被两个函数使用，您应该采用以下方法之一。

方法一：

为usl.model 定义一个反应函数，并在您的两个输出函数中引用它。

usl.model <- reactive({
    # some calculations probably ending in
    usl.model <- usl(as.formula(paste(yv, '~', xv)), data = df)
    usl.model
})

这允许您将模型输出引用为usl.model()（括号很重要！），例如

output$plot <- renderPlot( plot(usl.model(), add=TRUE) )

方法2

创建一个 reactiveValues() 变量来存储您在绘图函数中计算的 usl.model。

usl.model <- reactiveValues(data = NULL)

output$plot = renderPlot({
    # some calculations probably ending in
    usl.model$data <- usl(as.formula(paste(yv, '~', xv)), data = df)
})

然后您可以在任何地方引用您的模型输出为usl.model$data

方法二可能更糟糕，因为它需要先运行绘图函数。