为什么 'rmagic' %R 在读取文件时会导致错误，而 %%R 不会？答案

【问题标题】：Why does 'rmagic' %R cause an error when reading a file, while %%R does not?为什么 'rmagic' %R 在读取文件时会导致错误，而 %%R 不会？
【发布时间】：2014-03-30 20:34:15
【问题描述】：

使用rmagic 在阅读a particular file（而不是其他人）时，%R 和%%R 之间的行为不一致：为什么会这样

%%R

usda = read.csv("USDA.csv")

一边工作，一边

%R usda = read.csv("USDA.csv")

失败

---------------------------------------------------------------------------
TypeError                                 Traceback (most recent call last)
<ipython-input-64-01ec3b4742c8> in <module>()
----> 1 get_ipython().magic(u'R usda = read.csv("USDA.csv")')

...

/Library/Python/2.7/site-packages/numpy/core/numeric.pyc in asarray(a, dtype, order)
    458 
    459     """
--> 460     return array(a, dtype, copy=False, order=order)
    461 
    462 def asanyarray(a, dtype=None, order=None):

TypeError: __float__ returned non-float (type rpy2.rinterface.NAIntegerType)

同样，这只发生在 the linked file 上，而我尝试过的任何其他人都没有。

【问题讨论】：

标签： python r csv pandas dataframe

【解决方案1】：

这是我以前见过的缺失值处理问题。每当您缺少值时，它都应该发生。我不确定我们是否应该将其视为错误。但是%R -n usda = read.csv('USDA.csv') 使用-n 禁止返回（numpy array）将避免该问题。

还应注意，如果您在%R -n usda = read.csv('USDA.csv') 之后%Rpull usda，您应该同样得到相同的异常。

如果你想在这种情况下在python 和R 之间来回传输数据，我认为使用pandas 然后convert_to_r_dataframe 和convert_robject 会更好。

【讨论】：

但是为什么相同的代码应该适用于%%R，而不适用于%R。这对我来说似乎是一个错误。
不同之处在于%%R 不会尝试返回值，但%R 会尝试返回值，并且在将data.frame 作为array 返回时它属于一部分。也可能被视为错误。但是R -> python 的转换无论如何在很多情况下都很棘手。
啊，我现在明白了：-n 就是这样做的。有道理。