尝试按字母顺序合并数据表行/在 R 中查找表行总和？答案

【问题标题】：Trying to merge data table rows/find sum of table rows in R by alphabetical order?尝试按字母顺序合并数据表行/在 R 中查找表行总和？
【发布时间】：2015-08-04 16:28:07
【问题描述】：

这是我创建的数据表的一部分：

我正在尝试将基因行压缩成一行，并将 1、0 和 -1 添加在一起。

它看起来像这样：

ABTB2  1 
ABTB2  0
ABTB2 -1
AIRE   0 
AIRE   1
AIRE   1

看起来像这样：

ABTB2  0
AIRE   2

【问题讨论】：

使用dplyr，这应该可以工作，假设你的数据表被称为df:df.sum <- summarise(group_by(df, geneAlph), d.sum = sum(d))。
试试aggregate(d ~ geneAlph, FUN=sum, data=yourData)
或with(data, tapply(d, geneAlph, sum)

标签： r matrix dataframe

【解决方案1】：

数据表通常是最快的，当您拥有数百万行时，这是一个巨大的福音：

library(data.table)
setDT(mydata)[, n:=sum(d), by=geneAlph]

geneAlph n
1:    ABTB2  0
2:     AIRE  2

【讨论】：