【问题标题】:Overlay normal curve over histogram in faceting situation [duplicate]在分面情况下在直方图上叠加正态曲线[重复]
【发布时间】:2016-01-26 14:02:15
【问题描述】:

我已经用各自的 beta 模拟了一些 x 和 y 变量,我已经完成了引导并尝试使用 facet 绘制每个 beta 的直方图。但我想在每个方面分别覆盖每个 beta 的均值和标准差的正态分布图。您可以将数据模拟为,

require(simrel)
require(ggplot2)
require(reshape2)

sim <- simrel(n=50, p=10, m=2, q=5, relpos=c(1,3), gamma=0.25, R2=0.75, ntest = 50)
boot <- 200
b.boot <- matrix(nrow = boot, ncol = sim$p + 1)
r2.boot <- c()
for (i in 1:boot) {
  idx <- sample(1:nrow(sim$X), nrow(sim$X), replace = TRUE)
  dt <- data.frame(y = I(sim$Y), x = I(sim$X))[idx, ]
  lm.mdl <- lm(y ~ x, data = dt)
  b.boot[i, ] <- coef(lm.mdl)
  r2.boot[i] <- summary(lm.mdl)$r.squared
}
colnames(b.boot) <- paste("beta", 0:sim$p)
rownames(b.boot) <- 1:boot
sumry.beta <- as.data.frame(sapply(c("mean", "sd"), function(x){apply(b.boot, 2, match.fun(x))}))

我正在尝试使用ggplot为此,代码是一个

b.boot.mlt <- data.frame(melt(b.boot))

ggplot(b.boot.mlt[b.boot.mlt$Var2 != "beta 0",], aes(value)) + 
  geom_histogram(aes(y = ..density.., fill = Var2), bins = 30) + 
  facet_wrap(~Var2, nrow = 2) + geom_density(color = "gray") + 
  stat_function(fun = dnorm, 
                args = list(mean = sumry.beta$mean, sd = sumry.beta$sd), 
                color = "red", alpha = 0.5)

我得到的输出是,

我显然不想得到,我想在每个方面都得到一个正常的情节。 谁能帮帮我。谢谢!

【问题讨论】:

  • 谢谢Axeman,按照您给出的建议,我还没有得到想要的情节。感谢Hadley

标签: r plot ggplot2 facet-wrap


【解决方案1】:

我遵循了Axeman 的建议,并能够按照Hadley 的指导生成所需的绘图。我用了下面的代码,和帖子差不多,

b.boot.mlt <- b.boot.mlt[b.boot.mlt$Var2 != "beta 0", ]
grid <- with(b.boot.mlt, seq(min(value), max(value), length.out = 150))
dens <- plyr::ddply(b.boot.mlt, "Var2", function(x){
  data.frame(
    value = grid,
    density = dnorm(grid, mean(x$value), sd(x$value))
  )
})

ggplot(b.boot.mlt, aes(value)) + 
  geom_histogram(aes(y = ..density.., fill = Var2), bins = 30) + 
  facet_wrap(~Var2, nrow = 2) + geom_density(color = "gray") + 
  geom_line(data = dens, aes(y = density), color = "red", alpha = 0.5) +
  theme_bw()

谢谢!

【讨论】: