重命名unix文件夹中的多个文件答案

【问题标题】：Renaming multiple files in a folder in unix重命名unix文件夹中的多个文件
【发布时间】：2016-03-16 11:15:06
【问题描述】：

我想缩短名称的文件夹中有多个文件。这是输入文件

输入

S_12_O_319_K27ac_S12818.sorted.bam
S_12_O_319_K27me3_S12815.sorted.bam
S_12_O_319_K4me1_S12816.sorted.bam
S_12_O_319_K4me3_S12817.sorted.bam
S_14_AS_11_K27ac_S12843.sorted.bam
S_14_AS_11_K27me3_S12840.sorted.bam
S_14_AS_11_K4me1_S12841.sorted.bam
S_14_AS_11_K4me3_S12842.sorted.bam
S_12_O_319_K27ac_S12818.sorted.bam.bai
S_12_O_319_K27me3_S12815.sorted.bam.bai
S_12_O_319_K4me1_S12816.sorted.bam.bai
S_12_O_319_K4me3_S12817.sorted.bam.bai
S_14_AS_11_K27ac_S12843.sorted.bam.bai
S_14_AS_11_K27me3_S12840.sorted.bam.bai
S_14_AS_11_K4me1_S12841.sorted.bam.bai
S_14_AS_11_K4me3_S12842.sorted.bam.bai

输出

S_12_O_319_K27ac.bam
S_12_O_319_K27me3.bam
S_12_O_319_K4me1.bam
S_12_O_319_K4me3.bam
S_14_AS_11_K27ac.bam
S_14_AS_11_K27me3.bam
S_14_AS_11_K4me1.bam
S_14_AS_11_K4me3.bam
S_12_O_319_K27ac.bam.bai
S_12_O_319_K27me3.bam.bai
S_12_O_319_K4me1.bam.bai
S_12_O_319_K4me3.bam.bai
S_14_AS_11_K27ac.bam.bai
S_14_AS_11_K27me3.bam.bai
S_14_AS_11_K4me1.bam.bai
S_14_AS_11_K4me3.bam.bai

请注意，我的文件有两个不同的扩展名，一个是 *.bam，另一个是 *.bam.bai。我想一次重命名所有这些以缩短名称。从所有这些中删除部分_S12843.sorted。请注意，这是第 5 个下划线，而 _S12843 后面的数字对于不同的文件是不同的。只有类似的模式是字符串sorted。所以想截断整个部分以缩短名称。如何使用 bash 或 rename 或 sed 来实现这一点。任何帮助，将不胜感激。我可以删除带有排序但不是数字的字符串。

【问题讨论】：

Batch Renaming with Bash的可能重复

标签： bash unix awk sed file-rename

【解决方案1】：

使用rename 实用程序可以做到：

rename 's/_[^_.]+\.sorted//' *.sorted.*

如果您没有rename，请使用此for 循环：

for f in *.sorted.*; do
   mv "$f" "${f/_S[[:digit:]]*.sorted}"
done

【讨论】：

两者都有效，更喜欢循环中的一个，因为它消耗的时间更少。我没有新[:digit:] 的东西。你能解释一下吗？
[[:digit:]] 是 POSIX 属性，用于匹配 glob 或正则表达式模式中的数字 [0-9]
啊好吧，唯一的问题是识别_S，理想情况下这也应该工作for f in *.sorted.*; do mv "$f" "${f/_S[[0-9]]*.sorted}"; done
请注意，这是 perl 脚本 rename 可在 Debian/Ubuntu 及其衍生产品中找到，但不一定存在于其他非基于 Debian 的 Linux 机器上，例如 Arch Linux , CentOS, Slackware 等，我相信在那些盒子上使用了 util-linux 的重命名。 tl;dr 你不能依赖重命名的行为。

【解决方案2】：

这可能对你有用（GNU sed）：

sed -r 's/^(.*)_[^_.]*\.[^.]*(.*)/mv "&" "\1\2"/e' file

或：

sed -r 's/^(.*)_[^_.]*\.[^.]*(.*)/mv "&" "\1\2"/' file | shell

shell 可能是bash 等等

【讨论】：