R中的批量提交错误答案

【问题标题】：Error with batch submit in RR中的批量提交错误
【发布时间】：2013-08-30 15:12:34
【问题描述】：

我正在尝试在 Linux 上批量提交 R，但通常在提交后 30-40 分钟，该过程停止并且我收到以下消息。该消息出现在 .Rout 文件中，而不是 Linux shell 中。要提交，我使用 R CMD BATCH myprogram.R &

terminate called after throwing an instance of 'CxException'
  what():

当从 R 本身提交时，该程序可以正常运行，但由于某种原因，它在批量提交时在执行中途停止。 该过程在创建 45000 x 10000 矩阵时停止

这是该计划的概述。它首先从 CSV 读取三个文件。接下来，它会创建一个 45000 x 10000 的矩阵，占用大约 3.7GB 的 RAM。该矩阵是一个文档-词条矩阵，其中当词条在文档中时赋值为 1，否则赋值为 0。然后它会经过几个步骤，在这些步骤中使用该矩阵来产生结果。此时，RAM 增加到大约 4.5GB 并保持在该水平。我在 Linux 中监控作业，似乎有足够的空闲资源（包括 CPU 和 RAM）供其余进程运行。

任何想法/建议可能是什么原因造成的？

添加说明：
1) R 版本为Revolution R v.6.2； 2) 没有使用额外的包；

【问题讨论】：

你的算法是确定性的（不是随机的吗？）知道什么函数在抛出错误时被调用了吗？你用的是什么包？

标签： linux r batch-file

【解决方案1】：

使用Rscript.exe 而不是R CMD BATCH 可能会更好。

你想要使用的语法是：

"%PATH TO EXE%\Rscript.exe" "%PATH TO SCRIPT%\script.R" "INPUT ARGUMENTS (if any)"

【讨论】：

嗨，我试过了，但结果与 R CMD BATCH 相同。该过程停止，我得到同样的错误。

【解决方案2】：

这是 Rev-R 应该解决的问题。但是，您可以使用 R 会话中的源函数执行代码。语法是：

R -e 'source("Your_Script.R")'

【讨论】：