R pheatmap：在图例中使用对数缩放答案

【问题标题】：R pheatmap: use logarithmic scaling in the legendR pheatmap：在图例中使用对数缩放
【发布时间】：2018-07-14 04:47:43
【问题描述】：

我有一个矩阵

library(pheatmap)
set.seed(1)
mat <- matrix(rexp(200, rate=.001), ncol=20)
pheatmap(mat)

并且有一个值比其他值高得多。因此，我想对图例栏使用对数缩放（1、10、100、1000，...）。

pheatmap 包可以做到这一点吗？

编辑：我不想让log(mat)，我只想将颜色缩放条缩放为对数（1、10、100、1000，...）。

【问题讨论】：

标签： r pheatmap

【解决方案1】：

只需添加对数 legend_breaks 并显示最大值标签。

pheatmap::pheatmap(mat, legend_breaks=c(10^(0:ceiling(log10(max(mat)))), 
                                        round(max(mat), 2)))

收益

【讨论】：