R corrplot 产生空图答案

【问题标题】：R corrplot produces empty plotR corrplot 产生空图
【发布时间】：2014-12-04 17:45:31
【问题描述】：

我有一个包含 ~750k 元素的矩阵，我想用 corrplot 绘制它。它绘制它没有错误，但它产生的情节是空的，只有色标。使用命令行 R 时，它会在“Quartz 2”窗口中显示绘图，但几秒钟后就会消失。是什么赋予了？

library("corrplot")
mat <- matrix(data = rexp(200, rate = 10), nrow = 800, ncol = 800)
col1 <- colorRampPalette(c("#00007f", "#00007f", "#00007f", "#00007f", "blue", "cyan", "#00cc00", "yellow", "#FF7F00", "red"), interpolate = "linear", alpha = TRUE) 
corrplot(splotMat, is.corr = FALSE, method = "color", tl.pos = "n", col = col1(100), cl.lim = c(-0.14, 1))

【问题讨论】：

请给出一个最小的工作示例，例如描述here。首先，提供一小部分矩阵会有所帮助，例如 dput(Mat[1:20,1:20])。
好的。我已经更新了代码。谢谢。

标签： r plot r-corrplot

【解决方案1】：

我认为问题不在于代码，而在于绘图窗口的分辨率（即亚像素绘图）。我玩过尺寸低于 500x500 的矩阵，它在我的笔记本电脑屏幕上显示得很好。在 550 左右，我把它弄丢了（如你所见，空白）。当我将窗口移到更大的显示器上时，我最多可以绘制 800 个（尽管确实需要一段时间）。

为了查看它是否提供更高分辨率的渲染，我将其转储为 PDF 并放大：

## your data
library("corrplot")
mat <- matrix(data = rexp(200, rate = 10), nrow = 800, ncol = 800)
col1 <- colorRampPalette(c("#00007f", "#00007f", "#00007f", "#00007f", "blue",
                           "cyan", "#00cc00", "yellow", "#FF7F00", "red"),
                         interpolate = "linear", alpha = TRUE) 
## demonstration
pdf("foo.pdf", width = 20, height = 20)
corrplot(mat, is.corr = FALSE, method = "color",
         tl.pos = "n", col = col1(100), cl.lim = c(-0.14, 1))
dev.off()

该文件将相当大（~8MB），但您可以放大并查看各个单元格的颜色（可能很淡）。

【讨论】：

感谢您的回复。我想要它最初吐出并擦除的图像。我只能截个屏幕。但我似乎必须逐个像素地绘制绘图。伟大的。还是谢谢。
您始终可以使用png(...) 而不是pdf(...)，但您需要将分辨率和大小设置得足够大，以便提供所需的像素（例如，png("foo.png", res = 600, width = 6, height = 6, units = "in")）。
更改...png("foo.png", res = 600, width = 20, height = 20, units = "in") 有效，6 英寸无效。提高 res、宽度/高度，或两者兼而有之。
使用 png 无法按预期工作。在图像消失之前，它看起来像这样link，但使用 png 设备使图像像这样link。有任何想法吗？谢谢。
我不确定为什么，但绘制情节的第一阶段看起来像是没有应用 alpha 的颜色，并且与您的第一个链接相匹配。第二个链接看起来像我得到的。你期待看到什么？