R：networkD3 sankey plot - 颜色不显示

Question

我正在使用r 中的networkd3 包来生成sankey 图。我使用以下代码生成了一个工作图：

sankeyNetwork(Links = df_links, Nodes = df_nodes, Source = "source", 
              Target = "target", Value = "value", NodeID = "name", 
              units = "Cases", fontSize = 12, nodeWidth = 20)

但是，所有节点都是蓝色的，我认为包的默认输出是分别为每个节点着色。

当我尝试添加一个 NodeGroup 函数时，文档说它应该允许显示颜色，所有节点标签都消失了，所有节点现在都变成黑色。

sankeyNetwork(Links = df_links, Nodes = df_nodes, Source = "source", 
              Target = "target", Value = "value", NodeID = "name", 
              NodeGroup = "ID", units = "Cases", fontSize = 12, 
              nodeWidth = 20)

如果有人可以让我知道我哪里出错了，那将不胜感激。我怀疑我误解了NodeGroup 变量的用法 - 我目前正在为七个NodeIDs 中的每一个分配一个独特的组c(0,1,2,3,4,5,6,7)，最初的目的是让每个节点的颜色不同。这是对变量的正确解释吗？

Answer 1

您遇到的问题一定与您正在使用的数据有关，但我无法准确告诉您是什么，因为您没有共享它。如果我使用正确结构化的数据并将其用作输入，那么您的第一个准确的 sankeyNetwork() 命令将按预期工作（带有颜色）...

（有关NodeGroup 参数的讨论，请参见下文）

library(networkD3)

URL <- paste0('https://cdn.rawgit.com/christophergandrud/networkD3/',
              'master/JSONdata/energy.json')
energy <- jsonlite::fromJSON(URL)

df_links <- energy$links
df_nodes <- energy$nodes

sankeyNetwork(Links = df_links, Nodes = df_nodes, Source = "source", 
              Target = "target", Value = "value", NodeID = "name", 
              units = "Cases", fontSize = 12, nodeWidth = 20)

如果您查看帮助文件，NodeGroup 参数被描述为“指定节点中的节点组的字符串。用于为网络中的节点着色。”如果您将NodeGroup 指定为c(0,1,2,3,4,5,6,7)，那不是字符串。这可能就是为什么使用第二个sankeyNetwork() 命令所有节点都是黑色的原因。例如，请参阅 this question 关于使用 sankeyNetwork 着色组的信息。

此外，在“使用”部分的帮助文件顶部，您可以看到NodeGroup 的默认值是传递给NodeID 的任何值。因此，如果您没有为NodeGroup 分配任何内容，就像在您的第一个示例中一样，那么NodeID 将用作组...有效地为每个节点创建一个唯一组，该组将根据colourScale参数。

帮助文件中没有明确说明的一点是，似乎只使用了组名的第一个单词，因此在上图中，例如，“石油进口”、“石油储备”和“油”节点都被视为同一组的一部分，因此具有相同的颜色。