使用 Mayavi 进行 RGB 3D 体积渲染

Question

我使用 Mayavi 渲染 3D 体积，代码如下：

from mayavi import mlab
vol_mlab = mlab.pipeline.volume(mlab.pipeline.scalar_field(M))
mlab.colorbar()
mlab.show()

其中 M 是一个 3D 矩阵。我的问题是，如果体素具有描述 (R,G,B) 分量的三个值，是否可以使用颜色信息渲染体积？

Answer 1

几个建议：

1）如果你的标量和颜色对应一个通用的颜色图，你应该可以直接设置体积的颜色图

2) 您可以自定义卷的 ColorTransferFunction，如下所示：http://docs.enthought.com/mayavi/mayavi/auto/mlab_pipeline_other_functions.html#volume（转载如下）。因此，对于您的示例，只要您的颜色随着标量值平滑变化，就可以选择一些颜色的航点并将它们添加到 CTF 中

vol = mlab.pipeline.volume(src)

# Changing the ctf:
from tvtk.util.ctf import ColorTransferFunction
ctf = ColorTransferFunction()
ctf.add_rgb_point(value, r, g, b)  # r, g, and b are float
                                   # between 0 and 1
ctf.add_hsv_point(value, h, s, v)
# ...
vol._volume_property.set_color(ctf)
vol._ctf = ctf
vol.update_ctf = True

3) 你真的需要体积渲染吗？如果没有，可能更容易将其可视化为 3D 点并设置自定义颜色图，例如https://stackoverflow.com/a/30266228/209246。所以这看起来像是为每个体素分配一个标量，然后将体素的 RGB 颜色放入自定义颜色图的相应行中。