在 R 中使用连续变量绘制计数数据的箱线图答案

【问题标题】：Boxplotting count data with a continuous variable in R在 R 中使用连续变量绘制计数数据的箱线图
【发布时间】：2021-04-03 13:04:38
【问题描述】：

我在绘制计数数据时遇到问题。我有一个包含 420 个研究地点的数据集，其中包含每个地点的鸟类观察和海拔数据。研究地点在行中，不同的鸟类和海拔在列中。我的目标是绘制不同鸟类在海拔梯度（X = 鸟类，Y = 海拔）中的出现情况。

siteID	BirdA	BirdB	BirdC	elevation
1	3	2	0	275
2	1	5	1	550
3	0	0	3	850
4	4	3	2	322

我的问题是鸟类数据是计数数据。例如，站点 1 可能有三对鸟 A、两对鸟 B 和零对鸟 C，这使得箱线图有些困难。 boxplot 命令为具有不同观察量的站点创建不同的框（用于零观察、一个观察、两个观察、三个观察等的自己的框）。

我希望每种鸟类只需要一个框，并且我希望箱线图能够注意到具有若干对某些鸟类的地点/海拔，因为它提供了该特定鸟类最佳海拔的线索鸟类。我可以将计数数据更改为存在-不存在，但这会改变我的结果。

我发现解决方案是将具有三个 BirdA 观测值的行更改为三行，其中一个 BirdA 观测值位于某个高度。是否有命令或包可以帮助我将数据从计数数据更改为二项式？或者有没有更简单的方法来绘制这些值？

【问题讨论】：

你能解释一下你想要的输出吗？对于每种鸟类，您需要一个箱线图来指示计数的分布，以及您希望如何结合高程因子？
我希望每种鸟类都有一个箱线图，表明海拔因子的分布。如果您明白我的意思，我对计数的分布不感兴趣？这是一个链接，其中包含我正在寻找的示例：imgur.com/a/bYuZl25
问题是，如果我重塑数据，使每个唯一站点 id 有 3 行，每行有一种鸟，每种鸟都有相同的海拔，因此每个海拔的分布鸟对他们来说保持不变。我想不出任何其他方法可以为每种鸟类提供不同的海拔值。
欢迎堆栈溢出。请通过粘贴数据样本使您的问题可重现：使用dput(head(your_data_sample, n)) 其中n 足以证明问题的数据。这使其他人更容易测试和验证解决方案。

标签： r boxplot

【解决方案1】：

我不认为在此设置框中绘图适合 cmets 中的Anoushiravan R mentioned。此外，我希望这里的解决方案有点帮助：

library(ggplot2)
ggplot(df1, aes(fill=siteID, y=Count, x=Bird)) +
    geom_bar(position="stack", stat="identity") +
    theme_bw() +
    facet_grid( ~ elevation)

【讨论】：

谢谢 Anoushiravan R 和 TarJae。这极大地帮助了我了解如何展示和不展示我的数据。