在 Conda 中使用共享系统库

Question

我在共享计算集群上使用 Conda，其中已针对系统调整了数值库和 io 库。 我如何告诉 Conda 使用这些，而只担心 path 上尚未存在的库和包？

例如：

安装了openmpi 库，我想使用Conda 安装和管理的软件包也将其作为依赖项。 我怎样才能告诉 Conda 只是担心不那里有什么？

Answer 1

一个技巧是使用 shell 包 - 一个空包，其唯一目的是满足求解器的约束。这是 Conda Forge 对 mpich 所做的事情，如 this section of the documentation 中所述。也就是说，对于每个版本，它们都包含一个 external 构建变体，可以像这样安装

conda install mpich=3.4.2=external_*

表示它将由主机提供。具体例子可以咨询the recipe's meta.yaml。

我不认为这很好（看起来工作量很大），但我也不知道有更好的选择。