如何将 CLI 工具文件输出捕获到 R 对象或标准输出？

Question

我正在从 R 脚本调用一堆命令行界面 (CLI) 工具（例如 texi2pdf 或 pdf2svg，我想捕获输出文件这些工具中的直接作为 R 对象，不接触文件系统。

这是更频繁的“how-do-I-redirect-stdout-to-file”问题的相反问题。 （也许这意味着我“用错了”）。

示例：

说，我有一个简单的乳胶reprex.tex 文件，我想编译：

\documentclass{article}

\begin{document}

Foo.


\end{document}

在 R 中，我可以使用 tools::texi2pdf() 包装器，或者我可以自己发送命令将其编译为 pdf。

在外壳上，简单地说：

texi2pdf reprex.tex

等效地，从 R 中调用：

reprex_as_pdf <- system2(command = "texi2pdf", args = c(reprex.tex), stdout = TRUE, stderr = TRUE)

很方便，system2() 允许我通过 stdout = TRUE 将 stdout/stderr 捕获为字符向量，这让我成功了一半。

但是，我似乎在texi2pdf manpage 中找不到任何可以让我将（二进制！）输出重定向到stdout（这样，重定向到system2()）的内容。

如何在 R 中将texi2pdf 直接 的输出捕获为（原始）向量？

（奖励：我怎样才能将 input 作为 R 字符向量而不是文件传递给 texi2pdf？）

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解决方法

我当然可以通过tempfile() 工作，但是会触及文件系统，而且看起来不优雅/麻烦。

library(readr)
system2(command = "texi2pdf",
        args = c("reprex.tex"),
        stdout = TRUE,
        stderr = TRUE)
reprex_as_pdf <- read_file_raw("reprex.pdf")

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为什么有人愿意这样做？

我通常害怕副作用和跨机器/操作系统文件系统的恶作剧，并希望将副作用隔离到极少数功能。 此外，pdf 实际上将以编程方式导出，转换为各种不同的功能。 最后，我需要 很多 个这些 pdf，我希望它们在部署到可能没有 texi2dvi 的服务器之前轻松编译和缓存。

如果我绝对“用错了”，请阻止我。

Answer 1

简单地说：在一般情况下你不能。但有时这些工具允许您指定输出文件，在这种情况下，您可以（在某些系统上，但请注意这是不可移植）指定/dev/stdout 作为输出文件。

根据texi2pdf 联机帮助页，因此以下内容应该有效：

reprex_as_pdf <- system2(
    command = "texi2pdf",
    args = c("reprex.tex", "-o", "/dev/stdout"),
    stdout = TRUE, stderr = TRUE
)

但是，这并不妨碍该工具以其他方式接触文件系统（创建临时文件等）。没有办法阻止这种情况，也不是可取的：这些效果应该对用户透明。一个例外是生成多个输出文件（例如日志文件），不幸的是，TeX 相关工具经常这样做。

回答您的额外问题：这再次以独立于平台的方式是不可能的，但在 POSIX 系统上，您可以创建named pipe。但是，从 R 的角度来看，它的行为与普通文件一样，并且由文件系统管理。