Cox回归python答案

【问题标题】：Cox regression pythonCox回归python
【发布时间】：2016-03-15 20:44:16
【问题描述】：

Python 中有没有用于生存分析的包？具体来说，我有兴趣执行 Cox 回归？

我知道example，但它在 R 中。我们可以将 Python 与 R 接口（例如，使用 rpy2）吗？

【问题讨论】：

要求我们推荐或查找书籍、工具、软件库、教程或其他非现场资源的问题对于 Stack Overflow 来说是题外话，因为它们往往会吸引固执己见答案和垃圾邮件。相反，describe the problem 以及迄今为止为解决它所做的工作。
对不起，我不知道这个规则

【解决方案1】：

Python 中的生命线包提供生存分析，包括 Cox 比例风险拟合器：https://lifelines.readthedocs.io/en/latest/

【讨论】：

【解决方案2】：

我只想提供截至 2020 年 7 月的更新答案：

就像提到的ilse 一样，lifelines 是一个适用于所有事物生存分析的出色软件包。它与pandas 配合得非常好，并且有一些很棒的visualization tools 开箱即用。它正在不断开发和更新。此外，它的文档非常详尽。我什至建议将其作为学习生存分析的起点。
scikit-surv 是另一种选择。虽然它缺少一些生命线的功能，但它的强项是它基于scikit-learn，这使得它很容易与管道中的其他构建块耦合。此外，它还包括用于生存的 ML 算法的实现，例如 Random Survival Forests 和 SSVMs。
最后，我们有PySurvival。我对这个框架没有经验，但它看起来也有不少算法。它建立在PyTorch 等之上。

【讨论】：

【解决方案3】：

要添加到@arturo 列表的另一个库：

【讨论】：