【发布时间】:2020-10-29 07:14:29
【问题描述】:
我正在尝试使用 pivot_longer 函数将一长行基因 ID 转换为更长的列。 我正在使用以下代码:
file1 <- file1 %>%
tidyr::pivot_longer(cols = -Gene.ID, names_to = "tissue", values_to = "counts")
我收到以下错误:
Error: Can't combine `TSPAN6` <character> and `MT-CO2` <double>.
我认为我需要将列的默认值设置为字符,但我不确定如何在不影响列中值的情况下这样做。欢迎任何想法!
【问题讨论】:
-
将列转为字符,然后获取长格式数据。
file1 %>%mutate(`MT-CO2` = as.character(`MT-CO2`)) %>%tidyr::pivot_longer(......) -
感谢您的回答,我认为此数据中有多个列存在相同问题,可能需要一段时间才能全部编辑。有没有办法将整行基因名称更改为默认字符?
-
要将所有列转换为字符,请尝试
file1 %>%mutate_all(as.character) %>%tidyr::pivot_longer(......) -
这需要很长时间才能工作,所以我认为它正在完成整个文件
-
请使用
dput或我们可以复制和使用的东西添加数据。了解how to ask a good question 和how to give a reproducible example。