将新的 R 包添加到托管的 Beaker Lab 笔记本答案

【问题标题】：Adding new R packages to hosted Beaker Lab notebook将新的 R 包添加到托管的 Beaker Lab 笔记本
【发布时间】：2016-06-20 17:07:33
【问题描述】：

我想使用未包含在 Beaker 托管版本 Beaker Lab 的默认安装中的 R 包。代码：

install.packages("raster")

消息失败：

Error
Installing package into '/usr/local/lib/R/site-library'

有没有办法在 Beaker Lab 中安装新库？

【问题讨论】：

【解决方案1】：

要安装 R 包：

1) 打开暂存空间，点击BROWSE并创建目录rpackages

2) 创建一个空白的 R 笔记本

3) 类型：

install.packages(‘packagename’, ‘/mnt/scratch/rpackages’, repos=’http://cran.us.r-project.org’)

并运行单元格

4) 等待安装完成

5) 如果安装挂起一段时间，则意味着出现故障 -> 重新加载浏览器，关闭笔记本，重新打开笔记本并重新执行安装命令。这将从阻塞前的位置继续。

使用已安装的包：

在您的 R 笔记本中，在第一个单元格（或使用包之前的单元格）中键入：

.libPaths(c(‘/mnt/scratch/rpackages’,.libPaths()))

然后运行单元格

这是烧杯实验室的一个例子

【讨论】：