无法安装 ggplot2：“library.dynam (lib, package, package.lib) 中的错误：找不到共享对象‘stringi.so’”答案

【问题标题】：Cannot install ggplot2: "Error in library.dynam(lib, package, package.lib) : shared object ‘stringi.so’ not found"无法安装 ggplot2：“library.dynam (lib, package, package.lib) 中的错误：找不到共享对象‘stringi.so’”
【发布时间】：2015-08-06 21:41:59
【问题描述】：

上周我从 Ubuntu 14.04 升级到 14.10。自更新以来，我第一次尝试在 RStudio 中使用 ggplot，我的 ggplot 包出现依赖错误，并且不再注册为已安装（之前工作正常）。当我尝试重新安装 ggplot2 时：

install.packages("ggplot2",dep=TRUE)

尝试安装依赖项时安装失败。输出的尾部如下所示：

* installing *source* package ‘stringr’ ...
** package ‘stringr’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** R
** inst
** preparing package for lazy loading
Error in library.dynam(lib, package, package.lib) : 
  shared object ‘stringi.so’ not found
ERROR: lazy loading failed for package ‘stringr’
* removing ‘/home/james/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/stringr’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘stringr’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘stringr’ is not available for package ‘reshape2’
* removing ‘/home/james/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/reshape2’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘reshape2’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘reshape2’ is not available for package ‘ggplot2’
* removing ‘/home/james/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/ggplot2’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘ggplot2’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/RtmpWNyAha/downloaded_packages’

我觉得这是我应该查看的行（下方），但我不确定如何解释此错误，有人对我有什么建议吗？我真的不知道从哪里开始，因为我找不到任何其他人遇到与我相同的错误。

Error in library.dynam(lib, package, package.lib) : 
  shared object ‘stringi.so’ not found

不确定我所做的 Ubuntu 升级是否与此有关……但我想我会提一下以防万一。

【问题讨论】：

你应该使用引号：install.packages("ggplot2", dependencies = TRUE).
好收获！但这实际上只是我的问题中的一种类型，因为我确实包含了引号以获取我发布的输出。我已经更新了帖子。
尝试用install.packages("stringi")重新安装包stringi
似乎dependencies = TRUE 以ggplot2 失败。所以，你需要install.packages("stringr", dep=TRUE)，然后是install.packages("ggplot2", dep=TRUE)。
@Pascal：这是我的第一个想法，但依赖标志实际上工作正常。安装依赖包stringr时出现错误。即使在运行install.packages("stringi") 时，仍然会出现错误。 @尼克肯尼迪：太棒了！就是这样！我没有意识到stringi 是一个包。安装该依赖包时出错。我在下面添加了一个答案，以显示我必须采取的最后步骤来解决它。

标签： r ubuntu ggplot2

【解决方案1】：

根据@Nick Kennedey 的评论，我尝试像这样安装stringi：

> install.packages("stringi",dep=TRUE)

这导致了我以前从未见过的错误：

2015-08-07 10:26:35 (256 KB/s) - ‘/tmp/RtmpQI4Uau/downloaded_packages/stringi_0.5-5.tar.gz’ saved [3639183/3639183]

ERROR: failed to lock directory ‘/home/james/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1’ for modifying
Try removing ‘/home/james/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/00LOCK-stringi’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘stringi’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/RtmpQI4Uau/downloaded_packages’
> install.packages("stringi",dep=TRUE)

所以我按照错误中的建议删除了 LOCK 文件夹。

在终端：rm -r /home/james/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1/00LOCK-stringi’

然后尝试再次安装stringi 包，它成功了！这就是问题所在......现在我刚刚完成安装，没有任何问题。

不过，我仍然有点困惑......至于这个错误是如何产生的。关于导致这种情况的任何想法，以便我将来可以避免它？这可能是我最近升级到 14.10 的症状吗？

【讨论】：

install.packages("stringr", dep=TRUE) 安装 stringi... 但 install.packages("ggplot2", dep=TRUE) 既不安装 stringi 也不安装 stringr。
在这种情况下不是...我查看了我的 RStudio 历史记录，我可以确认我昨晚已经尝试过 install.packages("stringr" = TRUE) 并且没有解决错误。我不再有原始的控制台输出，但我想我记得stringr 安装返回的错误与我在安装带有依赖项的ggplot2 时遇到的错误完全相同。只有当我尝试安装 stringi 时，我才看到这个指向解决方案的新错误
在我的情况下，这是因为我通过强制关闭 R 取消了安装进度。这导致创建但不删除一些临时文件夹：ERROR: failed to lock directory ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4’ for modifying Try removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/00LOCK-stringi’。我按照指示删除了文件夹，重新安装了stringi，它可以工作了。
您的主目录或R 文件夹中是否有.RProfile，如果有，请您写下它的内容吗？

【解决方案2】：

安装install.packages("knitr")时遇到同样的错误

dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) 中的错误：无法加载共享对象'/usr/local/lib/R/site-library/stringi/libs/stringi.so'

我通过以下操作解决了它：

在 Ubuntu 16.04 及更高版本中

sudo apt install r-cran-stringi

在早期版本中（有 apt-get）

sudo apt-get install r-cran-stringi

【讨论】：

【解决方案3】：

就我而言，我通过从 linux 终端安装 stringi 和 ggplot2 解决了这个问题。该问题与 RStudio 有一定关系。

【讨论】：