bin 范围并使用边界形成数据框。答案

【问题标题】：bin range and form a data frame using the boundary.bin 范围并使用边界形成数据框。
【发布时间】：2013-08-09 13:11:58
【问题描述】：

假设我想生成范围为 1 到 10 的 bin

round(seq(1,20,length.out=5))

输出是

1 6 10 15 20

我想形成一个data.frame

     [,1] [,2]
[1,]    1    6
[2,]    7   10
[3,]   11   15
[4,]   16   20

所以起点分别是 1,7,11,16，终点分别是 6,10,15,20。

有什么解决办法吗？

【问题讨论】：

如何选择开始？范围是什么意思（是最大-最小吗？）？
你是怎么想出 1、7、11 和 16 的。只是 0+1、6+1、10+1、15+1 吗？
为什么要这样的data.frame？您可能能够更轻松地实现最终目标。告诉我们，您真正想要实现的目标。
我想将一个区域合并为相同大小的小区域。这听起来很像“切”。但我想要每个小箱子的非重叠边界以便进一步操作。更具体地说，我正在尝试对基因组区域进行分类，提取映射在该区域上的读取。为此，我需要一个 rangedData，并且为此目的生成了 data.frame。

标签： r

【解决方案1】：

x = round(seq(1,20,length.out=5))

df = data.frame(a = c(x[1], head(x[-1],-1) + 1), b = x[-1])

df
#   a  b
#1  1  6
#2  7 10
#3 11 15
#4 16 20

【讨论】：

【解决方案2】：

我不确定您是否正在寻找以下解决方案。如果你是，你可以使用cut 和sub 函数，就像我的earlier 帖子中一样：

mydata<-round(seq(1,20,length.out=5))
mydata<-as.data.frame(mydata)
names(mydata)<-"V" #name the column as V
mydata$V1<-cut(mydata$V,5) #break the data into five intervals and name that as col V1
mydata$lower<-with(mydata,as.numeric( sub("\\((.+),.*", "\\1", V1))) #extract lower value
mydata$upper<-with(mydata,as.numeric( sub("[^,]*,([^]]*)\\]", "\\1",V1))) # extract upper value
myfinaldata<-mydata[,c("lower","upper")] #create data frame of lower and upper values


  > myfinaldata
   lower upper
1  0.981  4.79
2  4.790  8.60
3  8.600 12.40
4 12.400 16.20
5 16.200 20.00

注意：虽然这些看起来像重叠的间隔，但它们不是。例如，对于第一行，这意味着所有数据>=0.981 但 =4.79 和

【讨论】：