将我的 python 模块导入到 rstudio

Question

我在 python 中开发了几个模块，我想将它们导入 rstudio RMarkdown 文件。但是，我不确定我该怎么做。

例如，我不能像我习惯在pycharm中那样做from code.extract_feat.cluster_blast import fill_df_by_blast as fill_df。

有什么提示吗？

谢谢。

Answer 1

首先我必须为我的项目创建一个 setup.py 文件。 激活我的项目source activate对应的虚拟环境，然后运行python setup.py develop

现在，我可以从 R 中导入我自己的 python 库，因为我将它安装在我的环境中。