如何评估 Rmarkdown 中的所有块答案

【问题标题】：How to evaluate all chunks in Rmarkdown如何评估 Rmarkdown 中的所有块
【发布时间】：2023-04-05 02:52:01
【问题描述】：

如何评估 Rmd 文档中的所有块，而不在每个块上放置 eval=TRUE？我在下面的方式，只评估第一个块。

```{r,eval=TRUE}
1+1
```

Some text

```
2+2
```

编辑：

我正在尝试编织/编译为 HTML。

```
require(knitr)
opts_chunk$set(eval = TRUE, tidy = TRUE, cache = FALSE, echo = FALSE, include = FALSE,
               fig.path = 'figures/', dev = c("pdf"),
               fig.width = 7, fig.height = 7)
```
some text

```
1+1
```
more text
```
2+2
```

【问题讨论】：

eval=TRUE 是默认值 - Ctrl+Alt+R (Windows) 应该运行所有块。您能否提供一个简短的 .Rmd 文档示例，该文档会产生您所看到的行为？
您的示例在打开围栏后丢失了{r}。

标签： r rstudio r-markdown

【解决方案1】：

eval=TRUE 是 .Rmd 块的默认行为，因此您不需要将其显式添加到块的选项中。

但是，您确实需要在打开栅栏之后包含{r}，以便将块识别为 R 代码并进行相应的评估。未使用 ```{r} 打开的块将不会运行，因此您会看到问题。

一个可行的例子可能是：

```{r}
1+1
```
Some text

```{r}
2+2
```

要插入带有适当栅栏和{r} 的新空块，您可以在 Windows 上按 Ctrl + Alt+i , 或 ⌘ + Option + i 在 Mac 上，或单击 RStudio 源窗格右上角的此图标（来自内存，旧版本的 RStudio 在该一般区域有一个“插入”下拉菜单）：

【讨论】：

【解决方案2】：

在您的第一个块中，您可以全局设置 knitr 选项。

opts_chunk$set(tidy = TRUE, cache = FALSE, echo = FALSE, include = FALSE,
    fig.path = 'figures/', dev = c("pdf"),
    fig.width = 7, fig.height = 7)

在任何后续块中，您可以通过常规方式更改它们，但它们仅适用于该块。

编辑。这是来自 K 的更完整示例。Broman

```{r global_options, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(fig.width=12, fig.height=8, fig.path='Figs/',
                      echo=FALSE, warning=FALSE, message=FALSE)
```

【讨论】：

这对我没有用——它没有评估块。我在 Rstudio 中，我的块由三个反引号而不是 >=...@. 分隔
您能否编辑您的问题以包含整个第一个代码块？
我添加了一个额外的例子。