R markdown / bookdown - 如何切换到文章？答案

【问题标题】：R markdown / bookdown - how to switch to rticles?R markdown / bookdown - 如何切换到文章？
【发布时间】：2017-02-18 07:48:19
【问题描述】：

输入数据

我准备了一个示例 Rmd 文件，其中引用了图形、表格和方程式，设置为输出“bookdown::pdf_document2”。它可以正确编译为 PDF。

我把它放在了 Dropbox 上： https://www.dropbox.com/sh/zmu0a4wq95ywssv/AAD-nHlkDiLknLk2NVR4Xup3a?dl=0

问题

现在我希望将输出格式设置为 'rticles::elsevier_article'

我该怎么做？

问题

当我从以下位置更改输出行时： bookdown::pdf_document2 到文章::elsevier_article

我收到一条错误消息。

即使我从输出中删除其他参数：

我仍然收到错误消息：

! Undefined control sequence.

【问题讨论】：

标签： r knitr bookdown

【解决方案1】：

“按原样”输入时的重音字符在elsevier_article 中表现不佳。请参阅以下建议。

基本文件

这是一个使用 rticles::elsevier_article 的简单文档：

---
title: "Sample document"
author: 
  - name: "Mateusz Kędzior"
    affiliation: Some Institute of Technology
    email: Mateusz@example.com
    footnote: Corresponding Author
  - name: Żąćł Źęń    
csl: https://www.zotero.org/styles/geoderma
output:
  rticles::elsevier_article:
    citation_package: natbib
    keep_tex: yes
    number_sections: yes
    toc: no
keywords: keywordA, keywordB
abstract: This is a sample abstract \newline This is the second line of abstract.
---

Hello world.

毫无怨言地呈现：

带重音符号的引用

现在，我们希望添加带有重音符号的引用。我们在这里遵循答案：https://tex.stackexchange.com/questions/57743/how-to-write-%C3%A4-and-other-umlauts-and-accented-letters-in-bibliography。我将您的参考书目导入 Zotero，然后使用“Central European (ISO)”编码（不是 UTF-8）导出该项目以获得

@article{kedzior_this_2018,
    title = {This is sample title only {\k A} {\L }},
    volume = {99},
    url = {http://megooglethat.com/},
    journal = {Some journal},
    author = {K{\k e}dzior, Mateusz and {\'Z}{\k e}{\'n}, {\.Z}{\k a}{\'c}{\l }},
    year = {2018},
    keywords = {keywordC},
    pages = {21 -- 31}
}

R Markdown 文档现在变成了

---
title: "Sample document"
author: 
  - name: "Mateusz Kędzior"
    affiliation: Some Institute of Technology
    email: Mateusz@example.com
    footnote: Corresponding Author
  - name: Żąćł Źęń    
csl: https://www.zotero.org/styles/geoderma
output:
  rticles::elsevier_article:
    citation_package: natbib
    keep_tex: yes
    number_sections: yes
    toc: no
biblio-files: bibliography2.bib
keywords: keywordA, keywordB
abstract: This is a sample abstract \newline This is the second line of abstract.
---

## Citations and references

Let me cite an article: [@kedzior_this_2018]

# References

然后我在 RStudio 中 knited 这个，但意识到我必须获得 tex 输出并重建它（在 RStudio 之外）以获得所需的输出

其他问题

对于图形标题中的重音字符，相应地对其进行编码（与参考书目一样）。您可能会发现 http://w2.syronex.com/jmr/latex-symbols-converter 很有帮助。此外，据我所知bookdown 样式交叉引用不适用于rticles。如果您有后续问题，如果您将问题分解成更小的部分，您可能会得到更有帮助的答案。

【讨论】：

"R Markdown 文档存在很多问题" --> 我认为您的这部分答案向读者表明我的文档根本不起作用。这不是真的，当您设置为输出 pdf_document2 时，它会编译 而没有 错误。我认为如果“重音字符”不是主要问题，但基本上应该对整个文档进行重大更改，最好简单地回答 rticles 不与 pdf_document2 兼容。
公平地说，我已经编辑了我的答案以澄清。我不知道rticles是否一定与pdf_document2不兼容。但确实需要在使用 Elsevier 模板时对参考书目和标题进行适当的编码。
谢谢！我接受了你的回答。我记得当我遇到重音字符和准备文章的问题时，我直接在我的 LaTeX 文档中使用了一些库来添加对 UTF-8 字符的支持...但是知道，我希望直接在 Rmd 中准备所有工作

【解决方案2】：

我在评论中添加了一些更新的材料 https://github.com/rstudio/rticles/issues/92#issuecomment-402784283 声明（可能会更新）：

output: 
  bookdown::pdf_document2:
    base_format: rticles::elsevier_article
    number_sections: yes

这样我完成这项工作的方式是使用pdf_book 与pdf_document2：

output:
  bookdown::pdf_book:
    base_format: rticles::elsevier_article
    number_sections: yes

这允许在 rticles 文档中引用图形和表格。

【讨论】：