【问题标题】:RMarkdown Shiny crashes when rendering ggplot plot渲染 ggplot 图时 RMarkdown Shiny 崩溃
【发布时间】:2017-08-30 14:32:03
【问题描述】:

我正在尝试使用闪亮创建一个交互式降价文件,并且在将 ggplot 与使用 rJava 的库一起使用时遇到了问题。使用 rJava 似乎不会造成问题。

我不得不将 openNLP 用于我想做的一些文本挖掘操作,当我使用 renderPlot(与使用 openNLP 完全无关)渲染 ggplot 绘图时,它导致文档崩溃,这正是 第二次时间

我后来注意到,当我只导入任何使用 rJava 的库时,就会发生这种情况。

我尝试了一些库并得到了相同的反应:openNLP、RWeka、wordnet、Rdrools

我在下面添加了一个示例要点供其他人尝试。

gist for the sample Rmd

我不明白为什么会这样。任何克服这个问题的提示将不胜感激。

R version:         3.4.0
Shiny version:     1.0.5
rmarkdown version: 1.5
pandoc version:    1.19.2.1

编辑:这似乎只是 3.4.0 或更高版本的问题。

【问题讨论】:

  • 我认为问题在于您的uiOutput("ggOut")。我认为不可能将多个输出传递给单个uiOutput...
  • 没有。即使我只有 plotOutput 而不是 UI 输出并尝试渲染绘图时也会发生这种情况。此外,当我不导入上述库时,相同的uiOutput 也可以工作。

标签: r ggplot2 shiny r-markdown opennlp


【解决方案1】:

由于这也是以前也遇到过的问题,因此我发布解决方案以帮助某人。

添加额外的 java 参数有助于解决问题。

options(java.parameters = "-Xss2560k")

相关的 SO 问题:rjava dependent package installation Segmentation fault (core dumped)

【讨论】:

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