根据我的经验,创建一个名为 Renviron.site 的文件并不能在我的所有 Windows 机器上工作,而将同一个文件命名为 .Renviron 却在所有地方都可以工作。不知道为什么。因此,如果您对上述建议有疑问,请尝试使用 .Renviron 作为名称。
请不要犹豫对我的建议进行批判性评论,因为当我描述对我有用的方法时,它可能有我不知道的困难。
根据我的经验,以下方法有效:
Windows 和 Linux 平台:
设置 R 路径
找出默认路径:
.libPaths()
临时设置路径(在 R 脚本中)
.libPaths( "F:/Rlib" )
其中 F 可能是与 USB 驱动器相关联的字母。
查询路径(Windows 和 Linux):
Sys.getenv('R_LIBS_USER')
Sys.getenv('R_LIBS')
Sys.getenv('R_USER')
Sys.getenv('R_DOC_DIR')
Sys.getenv('HOME')
也可以试试:
normalizePath("~")
也可以试试:
getwd()
setwd(dir)
getwd 返回代表 R 进程当前工作目录的绝对文件路径
setwd(dir) 用于设置工作目录为dir。
Windows(测试时间:7x64)
创建一个名为 .Renviron 的环境文件
将其放在工作目录或主目录中:
"C:/Users/username/Documents"
一些用户报告说 .Renviron 文件需要位于“c:/users/username/”中。如果您不确定将其放置在何处,请保存桌面历史记录并查看 .Rhistory 文件的位置。然后将您的 .Renviron 文件放在同一位置。保存历史 savehistory()
# Windows .Renviron file:
R_LIBS_USER="C:/R/library"
R_USER="C:/R"
R_DOC_DIR="C:/R"
HOME="C:"
设置全局路径
我的电脑/属性/高级系统设置/环境变量-->用户变量-->路径-->编辑
c:\R;c:\R\库;
Linux(在 kUbuntu 12.10 上测试)
创建一个名为 Renviron.site 的环境文件
把它放在:
/etc/R/
查询路径以检查您的系统是否正在读取 Renviron.site 文件。
# Linux Renviron.site file:
R_LIBS_USER="~/R/library"
R_USER="~/R"
R_DOC_DIR="~/R"
#HOME="/home" # may not be needed
备注:afaik 文件是从下到上读取的,所以 HOME 定义在底部。在我的设置中 ~ 被正确分配给 /home/ 所以我还是省略了最后一行。
如果您使用 RStudio,您可能还需要在 RStudio 程序目录中添加一个 rsession.conf 文件。以下对我有用:
# Windows 7:
r-libs-user="C:/R/library"
# Kubuntu 12:
# r-libs-user=~/R/%p-library/%v