直接从github加载.RData答案

【问题标题】：Directly loading .RData from github直接从github加载.RData
【发布时间】：2019-06-14 16:34:31
【问题描述】：

我想从https://github.com/myaseen208/PakPMICS2018Data/ 加载PakPMICS2018bh.RData 数据并使用以下引发错误的代码：

library(RCurl)
PakPMICS2018bhURL <- "https://github.com/myaseen208/PakPMICS2018Data/raw/master/PakPMICS2018bh.RData"
load(url(PakPMICS2018bhURL))

加载错误（url（PakPMICS2018bhURL））：输入不是以与从连接加载兼容的幻数开头

我想知道我的代码有什么问题。请帮忙。

【问题讨论】：

标签： r url github load

【解决方案1】：

问题不在您的代码中，它应该可以正常工作。这例如从github正常加载一个Rdata文件

load(url("https://github.com/mawp/spict/raw/master/spict/data/pol.rda"))

您的问题来自您尝试打开的文件，它们以 R 版本 3.5 中引入的序列化格式 3 保存，使用 save(version = 3)

R 具有支持 ALTREP 框架对象的自定义序列化的新序列化格式（版本 3）。这些对象仍然可以以格式 2 序列化，但效率较低。序列化格式 3 还记录未标记字符串的当前本机编码，并在以不同本机编码运行的 R 中反序列化时转换它们。格式 3 带有新的序列化幻数（RDA3、RDB3、RDX3）。格式 3 可以在 save()、serialize() 和 saveRDS() 中通过 version = 3 来选择，但格式 2 仍然是工作区所有序列化和保存的默认值。 R 版本 3.5.0 之前的版本无法读取格式 3 的序列化数据。

编辑

经过更多研究，我认为这是一个错误（或功能？）。对于使用等于FALSE、TRUE 或gz 的compression 参数保存的文件，代码在R 版本> = 3.5 中按预期工作。但是对于等于xz 的压缩，这似乎是您的情况，它不起作用。

有两种选择：要么使用 gz 压缩保存文件，要么使用@user113156 回答中的解决方法。

【讨论】：

感谢@alko989 的回答。我正在使用R version 3.6.0，那么您对这种情况有何看法？我该怎么办？
我只是在测试它（在 ubuntu 中将 R 更新到 3.5 有点困难），似乎加载功能不适用于新的序列化格式。可能是一个错误。

【解决方案2】：

你可以试试这个：

只要确保你设置了你的工作目录。

setwd("SET YOUR Working Directory - the file will download here")
working_directory <- getwd()
if (!file.exists("PakPMICS2018bh.RData")) {
  download.file(   "https://github.com/myaseen208/PakPMICS2018Data/raw/master/PakPMICS2018bh.RData",   "PakPMICS2018bhURL.RData")

  load(file.path(working_directory, "PakPMICS2018bhURL.RData"))
  }

【讨论】：

感谢@user113156 的回答。我的代码有什么问题？其实我只是想加载数据而不下载它。请有任何想法。
我不确定我是否理解技术上的区别。在不下载数据的情况下加载数据如何工作？目标是下载到临时文件，还是确保源文件在加载后被删除？

【解决方案3】：

如果可以read 而不是load 文件，这对我有用：

readRDS(url("https://.../FILENAME.rda"))

【讨论】：