【问题标题】:Unzipping a file in R Shiny using unzip() fails when deployed部署时使用 unzip() 在 R Shiny 中解压缩文件失败
【发布时间】:2015-10-19 22:47:51
【问题描述】:

我想在我闪亮的应用程序的www 文件夹中解压缩一个压缩的 .mdb 文件,在其中查询数据,然后将其删除。 Unzip() 在我的本地机器上工作,但是当我在 shinyapps.io 部署应用程序时,解压缩文件时出现问题。因为我无法 read.table() 生成的文件(它是一个 .mdb)我不认为 unz() 会工作。

此代码在我的本地机器上运行时有效

服务器:

require(shiny)    

shinyServer(function(input, output) {

   observeEvent(input$run,{ #Run Button

     dbName=unzip('www/test.zip', list=T)
     output$name=renderText({
        paste(dbName[1])
     })

     db=unzip('www/ttt.zip', exdir='www', unzip=getOption("unzip"))
     test1=read.csv(db) #.csv for simplicity, but my problem uses a .mdb
     file.remove(db)

     output$testcount=renderText({
        paste(sum(test1))
     })

  })#/Run Button  
})#/SS

用户界面:

shinyUI(
  sidebarLayout(
      sidebarPanel(width=3,

           h5('ZIP test'),                                           
           p(align="left", 
              shiny::actionButton("run", label = "Run!")
           ),                                           
           textOutput(outputId = "name"),
           textOutput(outputId = "testcount")                                           
      ),

      mainPanel(width=9,
           plotOutput(outputId = "probs",height = "550px")
      )                              
  )
)

但上传到 Shinyapps.io 时失败。

知道我在这里做错了什么吗?我试过直接传递文件路径,并弄乱unzip= 选项,但无济于事。如果我删除第二个调用,它会告诉我名称就好了,但如果我尝试解压缩文件,它会中断。

感谢任何帮助!

编辑

我能够通过删除 exdir='www', unzip=getOption("unzip") 并在根目录中查找文件来使其工作:test1=read.csv('file1.csv')

【问题讨论】:

  • 这对我有用,你能发布一些示例 zip 文件吗?
  • 我从未使用过 shinyapps.io,但如果您有命令行访问权限,您可以尝试检查 zip 文件的文件权限(并使用 chmod 755 myzip.zip 更改它们)。我还必须从您的 unzip 调用中删除 unzip=getOption("unzip") 部分,因为这会给出有关 Windows 特定选项的错误消息(如果 shinyapps 在 linux 上运行,请尝试删除它)。
  • 感谢您的回复!通过删除您建议的代码并将其解压缩到根目录(如@Sebastian 所述),我能够使其工作。

标签: r shiny unzip


【解决方案1】:

我在闪亮服务器上使用 unzip() 并且每次调用该函数时,.zip 的内容都会保存在应用程序的根目录中。我认为这是 shinyapps.io 的问题。

在文档中,您只能使用我阅读的“exdir”指定文件所在的位置。

【讨论】:

  • 感谢建议,解压到根目录有效。
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