在 R 上安装包答案

【问题标题】：Installing packages onto R在 R 上安装包
【发布时间】：2013-05-16 20:19:20
【问题描述】：

由于某种原因，我突然无法在 R 中安装软件包（我随后更新到最新版本的 R 并且正在运行 Windows 7）。例如，如果我输入：

install.packages('beeswarm')

将软件包安装到“D:/Rlibs”（因为“lib”未指定） --- 请选择在此会话中使用的 CRAN 镜像 --- 尝试 URL 'http://www.stats.bris.ac.uk/R/bin/windows/contrib/3.0/beeswarm_0.1.5.zip' 内容类型 'text/html' 长度未知打开的 URL 已下载 1859 字节

read.dcf(file.path(pkgname, "DESCRIPTION"), c("Package", “类型”））：无法打开连接另外：警告消息：1：在解压缩中（zipname，exdir = dest）：提取时出现错误 1 来自 zip 文件 2：在 read.dcf(file.path(pkgname, "DESCRIPTION"), c("Package", "Type")) : 无法打开压缩文件 'beeswarm/DESCRIPTION'，可能的原因'没有这样的文件或目录'

我已经读到，在 Windows 7 中，对某些文件夹的写入权限等可能存在重要限制，因此我已竭尽全力在计算机的非默认区域安装 R 和库文件夹，并允许我自己对某些文件夹的权利，但无济于事。当我键入时，可能也很重要：

.libPaths()

# [1] "D:/Rlibs"                                             
# [2] "C:/Users/L.Halsey/Documents/R/win-library/3.0"        
# [3] "C:/Users/L.Halsey/Documents/Documents/R-3.0.1/library"

我创建了几个文件夹，试图创建一个可以成功安装库的文件夹，并使用开始按钮中的“环境变量”将它们设置为被 R 识别。我不知道如何删除它们中的任何一个 - 不确定这是否与我现在由于某种原因无法安装/更新软件包的整体问题有关。

【问题讨论】：

标签： r installation package cran

【解决方案1】：

报告的错误是无法打开连接。在 Windows 中是 often a firewall problem and is in the Windows R FAQ。通常的第一次尝试应该是运行 internet2.dll。在控制台会话中，您可以使用：

setInternet2(TRUE)

（您认为这不是由于您的库设置是正确的。错误没有说明权限。）我不认为只输入 .libPaths 应该返回该字符向量，因为在我的机器上我需要输入.libPaths() 看到类似的东西。如果您想减少库的位置数量，您可以使用.libPaths 函数来设置值。这将选择现有路径的第二个和第三个

 .libPaths( .libPaths()[2:3] )

内部调用检索路径向量，外部调用将其设置为缩减向量。

【讨论】：

【解决方案2】：

我可能会在 stackoverflow 上复制很多其他答案，但我得到了与 OP 完全相同的错误，即： Warning messages: 1: In unzip(zipname, exdir = dest) : error 1 in extracting from zip file 2: In read.dcf(file.path(pkgname, "DESCRIPTION"), c("Package", "Type")) : cannot open compressed file 'zoo/DESCRIPTION', probable reason 'No such file or directory'

原来，虽然我作为用户有权在某个目录中写入，但 R 没有。为了确保您没有类似的东西，请执行以下操作：

得到一个 USB 驱动器，我们将它命名为 E
将包源下载为 .zip 文件并将其存储到 USB 驱动器的某个目录中，我们将其命名为 E:/source
在 USB 驱动器上为库创建目录，我们将其命名为 E:/libs

从 R 控制台安装调用 R 命令 install.package 的软件包，并将所有相关目录设置为指向您的 USB 驱动器：

（这里我以包zoo为例）

install.packages("E:/source/zoo_1.7-12.zip", 
                 destdir = 'E:/source',  # no "/" after the path
                 lib = 'E:/libs', 
                 repos = NULL)

从安装包的目录加载包： library('zoo', lib.loc = 'E:/libs')

确定后，它在你的U盘上是这样工作的，你可以开始解析目录权限，并通过更改上面代码中的路径来尝试。

更新： 在某些 Windows 环境中，甚至您的 USB 记忆棒也可能受到 R 的读写保护。请确保您使用正在使用的机器检查权限。

【讨论】：

【解决方案3】：

以下对我有用（基于上面的答案）

install.packages("clustvarsel", lib = "C:/Users/dnentchev/My Programs/R-3.2.2/library")

【讨论】：

【解决方案4】：

以管理员身份运行 RStudio 已为我解决了这个问题！

【讨论】：

【解决方案5】：

我遇到了同样的问题。我关闭了 Windows 防火墙，并以管理员身份运行 RStudio。因此，该错误已修复。

【讨论】：