如何在 R-package 中正确包含依赖项？

Question

我现在尝试了几个小时在 R 中构建一个包，并且对我的进步有多慢感到有些绝望。我很快就构建了一个没有依赖项的包，一切正常。由于几篇文章的建议，我正在使用 R Studio、devtools 和 Roxygen2（在 Windows 上）。对于依赖项，我在检查时遇到问题（例如使用 devtools::check() ）：

检查 R 代码中的依赖关系...注意 Imports 字段中的命名空间 未从：'ggplot2' 导入所有声明的 Imports 都应使用。 请参阅“创建 R”一章中有关说明文件的信息 'Writing R Extensions' 手册中的包'。

此外，check() 删除命名空间中的import(ggplot2) 行。如果我检查（document=F），它会给出一个关于未加载的digest 包的神秘错误。我阅读了'Writing R Extensions' - 1.1.3 Package Dependencies 和 Hadley's Wiki，了解如何编写包，但无法解决我的问题。 CRAN 中其他 R 包的说明和命名空间文件与我的看起来没有什么不同（在我看来）？

问题：我做错了什么？对于这样一个基本问题，我很抱歉，但我很茫然，到目前为止我看到的大多数分步教程在解释依赖关系之前都停止了。

到目前为止，我有 3 个文件：
描述：

Package: test
Type: Package
Title: Foo
Version: 1.0
Date: 2014-03-21
Author: Bar
Maintainer: Foo <bar@mail.com>
Description: Blubb
Imports:
    ggplot2
License: GPL-3

命名空间：

export(is.equal.null)
import(ggplot2)

一个 R 文件：

#' Extension of compare to include NULLs
#'
#' Works as an extension to usual compare
#' Compares two basic objects which in addition to usual compare can be NULL
#' Intuitive output: TRUE if both are equal or NULL resp., FALSE if both are unequal or only one is NULL
#'
#' @param obj1 Basic object like \code{numeric, char, boolean, NULL}
#' @param obj2 Basic object like \code{numeric, char, boolean, NULL}
#' @keywords compare
#' @export
#' @examples
#' is.equal.null(5,5)  # TRUE
#' is.equal.null(5,NULL)  # FALSE
#' is.equal.null(NULL,NULL)  # TRUE
is.equal.null <- function(obj1, obj2) {
  # Small helper function to generalize comparison to comparison of NULL
  # returns TRUE if both are NULL, and FALSE if only one of the objects is NULL
  bool <- obj1==obj2 
  #qplot(obj1)
  if (length(bool)) return(bool)
  if (is.null(obj1) & is.null(obj2)) return(TRUE)
  return(FALSE)
}

Answer 1

您需要在两个处声明导入：

1. 说明文件。您应该有类似于以下内容的行：

   Imports: ggplot2, pkg1, pkg2
   

2. 命名空间文件。在这里你声明你需要的包

   import(ggplot2)
   

   或避免命名空间冲突

   importFrom(ggplot2, geom_point)
   

   您可以使用@import 和@importFrom 标签让roxygen2 维护NAMESPACE 文件。

在您的示例中，您的说明文件看起来不错，但您尚未向 NAMESPACE 添加必要的功能。