构建一个读取示例 .rda 文件的 R 包小插图？

Question

我有一个与此处发布的内容类似的问题，并尝试以类似的方式设置我的文件夹：(Writing an R package vignette that reads in an example file?)

我正在为 R 中的一个包编写一个小插图。

我创建了一个 .Rnw 文件并将其放入我的包 pV 内的子目录 inst/doc 中。在同一个子目录 inst/doc 中，我放置了一个文件夹示例，其中包含一个名为 tree.rda 的 .rda 文件。

在我可以运行小插图中的任何函数之前，我必须阅读 tree.rda 文件（这是第 13-21 行）：

```{r}
library(pV)
library(plyr)
library(reshape2)
library(ggplot2)
library(stringr)
library(igraph)
system.file('tree.rda', 'example', package = 'pV')
load("tree.rda")
```

但得到错误：

* checking for file '/Users/MacOwner/Desktop/pV/DESCRIPTION' ... OK
* preparing 'pV':
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ... ERROR
Quitting from lines 13-21 (pV.rmd) 
Error: processing vignette 'pV.rmd' failed with diagnostics:
cannot open the connection
Execution halted
Error: Command failed (1)

我怎样才能成功读取 .rda 文件，以便我的下一个命令可以是（并显示 tree.rda 文件的第一行）：

```{r}
head(tree)
```

这样我就可以使用这个树对象作为附加函数的输入，这些函数需要它作为小插图后面部分的输入？

Answer 1

如果我理解您的问题，您需要分配 system.file 的结果或嵌套命令。所以要么：

file <- system.file('tree.rda', 'example', package = 'phyViz')
load(file)

或

load(system.file('tree.rda', 'example', package = 'phyViz'))

应该使数据可用。在命令行上试试看，然后ls() 看看有没有。