fread、data.table 中的小数点设置答案

【问题标题】：decimal point setting in fread, data.tablefread、data.table 中的小数点设置
【发布时间】：2013-11-13 15:57:46
【问题描述】：

我想使用 data.table 中的 fread，但会收到与小数点相关的警告 [这里是 ',' 而不是 '.']。通常我使用'.'，但在某些情况下我必须以'，'作为小数点导入文件。

在 read.csv 中我可以设置小数点分隔符：

df <- read.csv("mydata.csv", sep=";", dec=",")

如何在 data.table 的 fread 函数中执行此操作？与

df=fread('mydata.csv',sep=';')

我收到一条警告消息：

Warning message:
In fread("mydata.csv",  :
Bumped column 7 to type character on data row 86, field contains '4,5'.

，其中 4,5 是在 read.csv 中正确读取为 '4.5' 且 sep=',' 的值。

sessionInfo()
R version 3.0.2 (2013-09-25)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C               LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8     LC_MONETARY=en_US.UTF-8   
 [6] LC_MESSAGES=en_US.UTF-8    LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                  LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C

【问题讨论】：

您使用的是什么操作系统？ See here 解决方法。
@SimonO101 - 我在 Linux Debian 64 位。我必须导入 ',' 和 '.' 的组合。小数点文件，因此更改语言环境无济于事。
没有理由不能在两次读取之间更改它。一旦数据进入，R 会以同样的方式对待它（即使用 .，除非您在 options(OutDec) 中指定不同的内容。
谢谢。由于问题出在单个文件上，因此我将只进行搜索/替换。

标签： r data.table

【解决方案1】：

2014 年 10 月更新：现在在 v1.9.5

fread 现在接受dec=','（和其他非'.' 小数分隔符）、#917。 ?fread 添加了一个新段落。如果您位于使用dec=',' 的国家/地区，那么它应该可以工作。如果没有，您将需要阅读该段落以获得额外的步骤。如果它以某种方式破坏dec='.'，可以使用options(datatable.fread.dec.experiment=FALSE) 关闭此新功能。

上一个答案...

由于您使用的是 Linux，因此使用 data.table 1.8.11 您可以执行以下操作：

fread("sed 's/,/./g' yourfile", sep = ";")

（其实我觉得你甚至不需要在这里指定sep）

【讨论】：

+1 我正要粘贴这个（我花了一段时间才弄明白！）。你不需要echo 结果吗，例如fread( "echo | sed 's/,/\\./g' C:/Data/mydata.csv" ) 并且由于它是一个系统调用，它不会在 R 中的当前工作目录之外工作，所以您需要指定路径？
@SimonO101 刚刚检查过，它像宣传的那样工作:) （至少在普通 Linux 上 - 听起来你在 Mac 上，我从未在 Mac 上测试过），路径规则是与没有sed 的简单fread 相同； echo 在 Linux 上也不会做任何事情（再次不确定 Mac）
遗憾的是，我在工作中使用 Windows 并使用GoW（Windows 上的 GNU）但是我刚刚检查过，我不需要echo，此外路径规则被搞砸了使用 UNC 路径名映射的网络用户共享 - 在本地驱动器上工作得很好！我应该更仔细地测试！ :-)
@eddi- 是的！ linux 规则，和往常一样。适用于 fread("sed 's/,/./g' 'yourfile'", sep = ";") [quotes around yourfile]。谢谢！