如何使用行标题列表按行名对矩阵进行子集化答案

【问题标题】：How do I subset a matrix by rownames using a list of row headers如何使用行标题列表按行名对矩阵进行子集化
【发布时间】：2014-04-08 16:26:04
【问题描述】：

我有一个名字列表（mylist）。此名称列表与（大得多的）文件中的某些行名称一致，该文件还包含其他数据列（大文件）。如何提取与“mylist”中的名称匹配的“bigfile”中的行？

【问题讨论】：

标签： r list submatrix

【解决方案1】：

Hadley's page on subsetting in R 是一个值得一看的好地方。

就问题的具体答案而言，让我们假设您有一个原始的行名列表，您希望将其作为子集，称为“mylist”。您可以执行以下操作：

index <- row.names(bigfile)  %in% mylist[,1]

这应该给出一个与大文件中的行数一样长的布尔表达式。

编辑：您还可以查看following Stackoverflow post which nicely addresses the problem。

【讨论】：

谢谢。我使用了“索引”的东西。这回答了我的问题。
太棒了！将清理答案以反映这一点！
这真是个好地方 :-)

【解决方案2】：

# collect the names from the bigfile
BigFileNames <- colnames(bigfile)

# find the intersect between your list and the list of names from Bigfile
common <- intersect(BigFileNames, myListNames)

# extract info from dataframe 
infoFromCommon <- bigfile[,match(common, myListNames)]

【讨论】：

【解决方案3】：

在给定行名的情况下提取矩阵的子集。在片段下方，从用户矩阵中提取子集，其中行名与从数据框 activity_data_t 中提取的给定用户列表匹配

r_users = users[rownames(users) %in% unique(activity_data_t[activity_data_t$role_id == target_latest_role, "user_id"]),]

【讨论】：