将 geom_smooth() 拟合到 ggplot2 中的多个类别答案

【问题标题】：fitting geom_smooth() to multiple categories in ggplot2将 geom_smooth() 拟合到 ggplot2 中的多个类别
【发布时间】：2017-11-13 20:21:51
【问题描述】：

我有一些看起来像这样的数据：

sample  diff    chromosome  haploid coverage
B   90.9963099631   7   b   0.513
A   91.7019475021   12  a   8.234
C   90.3855783676   14  a   6.211
D   91.3407821229   17  b   4.321
E   91.5740740741   11  b   0.213
F   90.9963099631   7   b   0.513
G   91.7019475021   12  a   8.234
H   90.3855783676   14  a   6.211
I   91.3407821229   17  b   4.321
J   91.5740740741   11  b   0.213

我想可视化不同覆盖率值的“差异”变化，跨越不同的染色体，所以我这样做了：

plot = ggplot(dat, aes(x = coverage, y = diff, group  = chromosome, colour = chromosome, ylim(0, 100)) ) + geom_point(colour = chromosome) + stat_smooth(se=FALSE) + ylim(0, 100)

`geom_smooth()` using method = 'loess'

现在我认为这不是绘制多条趋势线的最佳方式，但我制作了这个：

这正是我所追求的。但我认为实际上，根据我的数据，所有曲线的形状不应该完全相同，但所有曲线的形状基本相同。那么 geom_smooth() 是否为所有类别绘制了一条 LOWESS 曲线，然后为不同的类别上下移动相同的曲线？

如果是这样，有没有办法让它为每个类别绘制独立的线？

【问题讨论】：

您在示例中使用的是 stat_smooth 而不是 geom_smooth。你确定这是产生这个情节的代码吗？

标签： r ggplot2 statistics

【解决方案1】：

无法使用您提供的代码复制您的绘图。但是，使用 mtcars 数据集获取所需内容的正确语法如下。

library(ggplot2)

df = mtcars

df$cyl = factor(df$cyl)

ggplot(df, aes(x = mpg, y = disp, colour = cyl, group = cyl)) + 
  geom_point() + 
  geom_smooth(se=F)

尝试在此代码上调整您的示例/数据集。

【讨论】：