无法安装 R 包“nloptr”（Ubuntu 16.04 上的 R3.6.2）- C++ 编译器问题

Question

在 Ubuntu 16.04 上将 R 升级到 3.6.2（从 3.4）后，由于（至少一个）依赖项 (nloptr) 也无法安装，我无法安装“汽车”包。这似乎是 C++ 编译器的问题（它使用了一些已弃用的“配置”设置，但我在试图解决这个问题时迷路了）。

我在 R 中（从终端）调用了以下命令：

install.packages("nloptr")

错误信息：

Installing package into ‘/home/heike/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6’
(as ‘lib’ is unspecified)
--- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
trying URL 'https://ftp.fau.de/cran/src/contrib/nloptr_1.2.1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 2448313 bytes (2.3 MB)
==================================================
downloaded 2.3 MB
* installing source package ‘nloptr’ ...
** package ‘nloptr’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
'config' variable 'CPP' is deprecated
'config' variable 'CXXCPP' is deprecated
checking whether the C++ compiler works... no
configure: error: in /tmp/RtmpPLaJFA/R.INSTALL5e5ed06eeac/nloptr': configure: error: C++ compiler cannot create executables See config.log' for more details
ERROR: configuration failed for package ‘nloptr’

目前采取的步骤

• 更改了 CRAN 镜像和 source.list 条目
• 卸载并重新安装 R 3.6.2（也在不同的机器上），同样的问题仍然存在

系统信息

• 操作系统版本：Ubuntu 16.04 (x86_64-pc-linux-gnu (64-bit))
• R 版本：3.6.2 (2019-12-12)

Answer 1

我们做了很多工作来使 nloptr 安装更好。本质上，您有多种选择：

• 如果存在 nlopt 库的系统版本，请使用它——这是最简单的，因此请尝试通过sudo apt-get install libnlopt-dev 安装它，然后重新安装

• 如果找不到，则会下载源代码和构建版本，这似乎在您将近四年前的 Ubuntu 系统上失败了，因为它很难支持所有风格 --- 但这很有效在较新的版本上（我也运行 Ubuntu，但目前是 19.10）

• 有适合​​您的二进制文件，请参阅 Ubuntu packages page - 但是这些可能与您当前的 R 版本不匹配，这与您的发行版 R 版本不匹配

• 取决于您从哪里获得 R（您是否安装了 .deb？）您可以使用 Michael Rutter PPA 获取 当前 r-cran-nloptr

所有这些也可以在 r-sig-debian list for R on Debian 和 Ubuntu 上详细讨论。

编辑：回应以下评论：

• 要查看apt 知道什么包，请执行apt-cache policy r-cran-nloptr。根据我上面给出的链接，我们知道Ubuntu 有一个r-cran-nloptr 用于您的（非常旧的）Xenial 安装。但是，它会与您正在运行的非常新的和当前的 R 发生冲突。比如混搭的成本。

• 要访问 Rutter PPA 及其四千多个当前二进制文件，请参阅Ubuntu at CRAN README 顶部的第四段

编辑 2： 我可能太悲观了。当前 R 二进制文件的 Rutter PPA 具有可信赖的、xenial 和仿生的。见https://launchpad.net/~marutter/+archive/ubuntu/c2d4u3.5