【问题标题】:Cut a variable differently based on another grouping variable根据另一个分组变量以不同的方式切割一个变量
【发布时间】:2016-09-15 15:42:39
【问题描述】:

示例:我有一个按性别划分的身高数据集。 我想将高度分成低和高,其中切割点被定义为平均值 - 每个性别内的 2sd。

示例数据集:

set.seed(8)
df = data.frame(sex = c(rep("M",100), rep("F",100)), 
                ht = c(rnorm(100, mean=1.7, sd=.17), rnorm(100, mean=1.6, sd=.16)))

我想在一行矢量化代码中做一些事情,因为我很确定这是可能的,但是我不知道如何编写它。我想可能有一种方法可以使用cut()apply() 和/或dplyr 来实现这一点。

【问题讨论】:

  • 我的问题是什么导致人们投反对票?

标签: r dplyr aggregate tapply split-apply-combine


【解决方案1】:

使用来自 base R 的cut 怎么样:

sapply(c("F", "M"), function(s){
    dfF <- df[df$sex==s,] # filter out per gender
    cut(dfF$ht, breaks = c(0, mean(dfF$ht)-2*sd(dfF$ht), Inf), labels = c("low", "high"))
})
# dfF$ht heights per gender
# mean(dfF$ht)-2*sd(dfF$ht) cut point

【讨论】:

    【解决方案2】:

    在下面的代码中,我创建了 2 个新变量。两者都是通过对sex 变量进行分组并过滤ht 的不同范围而创建的。

     library(dplyr)
     df_low <- df %>% group_by(sex) %>% filter(ht<(mean(ht)-2*sd(ht)))
     df_high<- df %>% group_by(sex) %>% filter(ht>(mean(ht)+2*sd(ht)))
    

    【讨论】:

      【解决方案3】:

      刚刚使用base r 发现了以下解决方案:

      df$ht_grp <- ave(x = df$ht, df$sex, 
                       FUN = function(x) 
                             cut(x, breaks = c(0, (mean(x, na.rm=T) - 2*sd(x, na.rm=T)), Inf)))
      

      这是可行的,因为我知道 0 和 Inf 是合理的界限,但我也可以使用 min(x)max(x) 作为我的上限和下限。这导致一个因子变量被分为低、高和 NA。


      我之前的解决方案: 我想出了以下两步过程,这还不错:

      df = merge(df, 
                 setNames( aggregate(ht ~ sex, df, FUN = function(x) mean(x)-2*sd(x)), 
                           c("sex", "ht_cutoff")), 
                 by = "sex")
      
      df$ht_is_low = ifelse(df$ht <= df$ht_cutoff, 1, 0)
      

      【讨论】:

      • df %&gt;% group_by(sex) %&gt;% mutate(ht_is_low = as.integer(ht &lt; mean(ht) - 2*sd(ht)))