lapply pdf 输出覆盖 pdf 而不是创建新的

Question

如果有人可以在这里帮助我，我会很高兴。 因此，我尝试将 lapply 用于secondary.peaks（sangeranalysisrR包）功能，但是，我找不到将file.prefix更改为可以根据文件更改的内容的方法。这是我正在尝试和失败的地方。

lapply(list, secondary.peaks, output.folder = "/secondary_peaks",
   file.prefix = names(list))

所以，基本上问题出在 file.prefix 中，我希望列表中的每个文件都使用列表的名称。问题是当我制作一个名字列表时，它基本上只是取名字并将其重复到列表中的每个文件。因此，我没有以 5 个文件和 5 个名称结束，而是以列表名称的第一个文件结束。

Answer 1

lapply 仅迭代其X 参数中给出的对象。要遍历多个参数，您需要使用mapply。请注意，mapply 中的参数顺序略有不同。我会尝试（未经测试）

mapply(FUN = secondary.peaks, 
       s = list, 
       file.prefix = names(list), 
       MoreArgs = list(output.folder = "/secondary_peaks"))

如果您想确保将列表作为输出返回，您可以在mapply 调用中设置SIMPLIFY = TRUE。请务必阅读mapply 的文档。