重新编译以避免崩溃 R 会话答案

【问题标题】：recompiling to avoid crashing R session重新编译以避免崩溃 R 会话
【发布时间】：2019-01-15 09:23:23
【问题描述】：

如何避免重新编译？

我的 stan() 正在重新编译以避免 R 会话崩溃。

为了验证我的模型，我想为来自已知分布的许多数据复制各种模型。但是rstan::stan() 总是重新编译我的 stan 文件，所以花了很长时间。如何避免重新编译。

编辑评论-------------

从rstan::stan() 转换为rstan::sampling() 的备忘录。

在rstan::stan中，它的变量名是model_name

 m <- "foo.stan"
 rstan::stan( model_name =m, data =...)

另一方面，在rstan::sampling 中，它的变量名是object

   m <- "foo.stan"
   m <- stan_model(m)
   rstan::sampling( object = m , data = ...)

请小心！！变量名不一样！！

【问题讨论】：

标签： stan rstan

【解决方案1】：

使用函数stan_model进行编译，然后在sampling函数中使用编译后的模型输出。例如：

m <- stan_model('foo.stan')
fit <- sampling(m, data = ...)

而不是

fit <- stan('foo.stan', data = ...)

【讨论】：

是的，第一个 model_name 采用包含程序文本的文件的路径。第二个，stan_model，采用编译模型，就像你从 stan_model() 获得的模型一样。
我试过了，但是出现上述错误。这个错误是什么意思？
对于rstan::sampling 调用，您希望将stan_model() 生成的编译模型传递给它。