【发布时间】:2020-12-10 16:47:55
【问题描述】:
我有一个参数化的 R Markdown。基本上,我通过“case_id”字段过滤数据框并输出这些过滤结果的表格。我在循环中呈现 RMarkdown 文档,循环遍历每个唯一的 case_id。对于数组中的每个 case_id,我检查数据框,如果存在,我会输出一个过滤表,显示该 case_id 的结果。这里的工作示例:
RMarkdown:
---
title: "My Title"
output:
html_document:
params:
case: case
---
```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```
## My Table
```{r warning = FALSE, echo = FALSE, fig.height=10, fig.width=6}
data <- read.csv(text="case_id,event,group,start,end,color,line.color
3,event_1,Project,2020-06-15,2020-10-15,#ffffff,#FF0000
3,event_1,Meetings,2020-07-30,2020-07-30,#ffffff,#0000ff
5,event_1,Meetings,2020-08-30,2020-08-30,#ffffff,#FF0000
5,event_1,Meetings,2020-08-30,2020-08-30,#ffffff,#FF0000
5,event_1,Meetings,2020-08-30,2020-08-30,#ffffff,#FF0000
9,event_1,Meetings,2017-01-15,2017-01-15,#ffffff,#FF0000")
data$case_id <- as.numeric(data$case_id)
if(any(params$case==data$case_id)) {
#Filter PDMP by the selected case
data.filtered <- data %>%
filter(params$case==case_id)
data.filtered <- data.filtered %>%
filter(!is.na(start)&!is.na(end))
pdmp_numRows <- nrow(data.filtered)
if (pdmp_numRows>0) {
#Print table of prescriptions
data.filtered %>%
arrange(start)%>%
kable() %>% kable_styling(bootstrap_options = "striped","condensed", font_size = 12)
}
}
```
这里是渲染它的 R 脚本:
library(dplyr)
library(knitr)
library(rmarkdown)
#--------------------- Render RMarkdown Document ---------------------
case_array <- c(1:10)
render_data <- function(case) {
# assuming the output format of input.Rmd is PDF
rmarkdown::render(
"C:/Temp/test_kable.Rmd",
output_file = paste0('//my_directory/', 'test_cable_ex_',case, '.html'),
params = list(case=case),
envir = parent.frame()
)
}
for (case in case_array) {
render_data(case)
}
表格按预期输出。问题是,当没有表时(当过滤数据框的行 = 0 时),我不希望表标题“我的表”出现。我只想在表格存在时显示“我的表格”。
这就是我想要的:
这是我不想要的:
提前致谢!
【问题讨论】:
标签: html r r-markdown kable