将“稀疏矩阵”COO 格式的 data.frame 转换为实际的稀疏矩阵类？答案

【问题标题】：Convert a data.frame in "sparse matrix" COO format into an actual sparse-matrix class?将“稀疏矩阵”COO 格式的 data.frame 转换为实际的稀疏矩阵类？
【发布时间】：2016-12-01 22:43:54
【问题描述】：

我代表以下矩阵：

6  5  0
0  5  4
0  0  4

作为一个data.frame。 R 中的 data.frame 有三列。 COO格式如下：

请注意，没有行[1 3 0] 行，因为它的值为零而被省略。这同样适用于下三角值，也为零。

我想要做的是将它从 R 中的 Matrix 包中转换为 matrix.coo 或 dgCMatrix 类对象。

我不想先将其转换为常规矩阵，因为我正在使用的数据集非常大，并且编写一个循环将其转换为标准 R 矩阵需要太长时间。

【问题讨论】：

见?"CsparseMatrix-class"：我想你大概可以弄清楚如何使用new("dgCMatrix",...)来直接实例化它...

标签： r matrix

【解决方案1】：

查看?Matrix::sparseMatrix我们可以使用已经编码的函数如下：

myMatrix <- Matrix::sparseMatrix(i = coo$i, j = coo$j, x = coo$Xij, dims = c(42, 42))

【讨论】：

这非常有效。我尝试使用“新”（正如@ben-bolker 建议的那样），但这更灵活和直接。