R 中的 dbGetQuery 会截断非常长的 SQL 查询（长度为 10564 个字符）答案

【问题标题】：dbGetQuery in R truncates really long the SQL query (of length 10564 characters)R 中的 dbGetQuery 会截断非常长的 SQL 查询（长度为 10564 个字符）
【发布时间】：2017-09-11 23:48:28
【问题描述】：

我一直在尝试执行一个非常长的 SQL 查询并将结果放入 R 中的数据框中。但以下行会引发错误并在控制台中显示部分查询（截断它）

my_dataframe <- dbGetQuery(conn, my_large_query)

查询的长度是 10564 个字符，其中我使用了很多 CTE。我已经通过 R Studio 中的选项菜单删除了字符串截断，但我想知道 R 中的 dbGetQuery 函数是否存在字符限制？

有什么建议吗？

RDMBS：DB2（在 IBM AS400 上），
R 包：DBI（库 - RJDBC）

【问题讨论】：

您的要求可能取决于几个因素，包括您要连接的数据库和用于连接的包。也许您可以包含更多信息。（话虽如此，那么长的查询......难以理解。也许这可能会受益于减少查询、使用存储过程、使用视图、使用参数化查询等）
我们可以查看您尝试查询的部分内容吗？您可能会重复重复行，并且可以使用 DRY-er 解决方案进行优化。
这是查询的问题（我遇到了一个 CTE，它恰好是数据库中的一个“实际”表）。感谢您的回复

标签： sql r db2 r-dbi

【解决方案1】：

您提到了更改“字符串截断”，但是 warning.length 怎么样？

options("warning.length"={integer})

我还建议您首先在您的数据库可用的任何 GUI 中测试查询。当您验证查询没有问题时，然后在 R 中运行它。

当 dbGetQuery（假设是 DBI 包）抛出 sql/database 错误时，直到查询的全文之后才会显示错误的实际内容。换句话说，如果查询文本在 R 错误输出中被截断，那么即将出现的数据库错误代码/文本将根本不可见。问题可能是非常简单的问题，例如不匹配的括号或缺少逗号。

请注意错误消息是以Error in dbGetQuery（R 问题）还是Error in .verify.JDBC.result（数据库问题）开头。

【讨论】：

在 GUI (db2) 上执行，语法很好。选项（“warning.length”）是默认值（即 1000），我将其设置为 8170，并且不再显示截断的字符串，但我的会话突然崩溃
这是一个数据库问题“.verify.JDBC.result 中的错误”。更新了 SQL 语法 - 我正在从一个坏表中读取数据（恰好是数据库中的一个有效表）感谢您的回复：）感谢您的帮助。