我可以在不安装 Rtools 的情况下在 R 中使用 Rcpp 代码吗？答案

【问题标题】：Can I use the Rcpp code in R without installing Rtools?我可以在不安装 Rtools 的情况下在 R 中使用 Rcpp 代码吗？
【发布时间】：2018-08-09 02:44:33
【问题描述】：

我实验室的 Window HPC 服务器没有 Rtools，所以我在获取 Rcpp 代码时收到了这条消息。

Warning message:
running command 'make -f "C:/PROGRA~1/R/R-32~1.2/etc/x64/Makeconf" -f "C:/PROGRA~1/R/R-32~1.2/share/make/winshlib.mk" SHLIB_LDFLAGS='$(SHLIB_CXXLDFLAGS)' SHLIB_LD='$(SHLIB_CXXLD)' SHLIB="sourceCpp_1.dll" WIN=64 TCLBIN=64 OBJECTS="MultiBayes.v1.o"' had status 127 
Error in sourceCpp("./rcode/MultiBayes.v1.cpp") : 
  Error 1 occurred building shared library.

WARNING: The tools required to build C++ code for R were not found.

Please download and install the appropriate version of Rtools:

http://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/

Execution halted

由于管理人员说在服务器中安装 Rtools 可能需要很长时间，我想知道是否有其他方法可以避免此问题并在不安装 Rtools 的情况下运行 Rcpp 代码。

据我所知，构建一个包不会有帮助，因为它在安装时也使用 Rtools。如有错误请指正。

我可以绕道运行代码吗？

感谢任何 cmets 和想法。

【问题讨论】：

标签： r rcpp rtools

【解决方案1】：

简单地说：

如果您碰巧安装了 gcc 等的二进制相同版本（包括补丁），那么狭义的答案是“是的，理论上你可以不用 Rtools”。实际上，您不能（在 Windows 上）。
一种简单的解决方法是在 HPC 服务器之外编译代码的包，并在其上部署该包的二进制构建。简单的。并且二进制文件不需要 Rtools！
如果您从事 HPC，您可能还想研究一下 Linux。

【讨论】：

他说了什么。请注意：如果您缺少 Windows 计算机或 VM，可以使用win-builder 服务构建软件包的 windows 二进制文件并下载。
@Dirk 再次非常感谢！我做到了 2 :)
@Inmybrain：很酷，所以请随意接受答案。

【解决方案2】：

感谢 Dirk Eddelbuettel，我继续使用解决方案 2 来处理我的问题

这就是我所做的。

构建包含 .cpp 代码的 R 包，并创建包源（例如 YourPkgName_1.0.tar.gz）
安装软件包以在您的桌面上创建库。例如，

install.packages(pkgs = "C:/Users/User/Desktop/YourPkgName_1.0.tar.gz", repos = NULL, type="source")
将已安装的库从默认文件夹（您的桌面）移至服务器。我的本地网址是

C:\Program Files\R\R-3.5.1\库
您可以通过在 R 脚本中包含以下命令，在未安装 Rtools 的服务器下加载 R 中的 cpp 函数。

library("YourPkgName", lib.loc = "YourPersonalLibraryDirectory")

【讨论】：

你应该按照 WRE 手册使用R CMD build --binary ...。
@DirkEddelbuettel 感谢您的建议！
这是要走的路，因为它将创建 binary 包，然后您可以将其安装在节点上。