文章中的交叉引用

Question

这本书为方程式、图形、表格和部分提供了很好的交叉引用选项： https://bookdown.org/yihui/bookdown/cross-references.html

但是，当我设置为输出 'rticles::elsevier_article' 时，它们似乎不起作用。

文章中的交叉引用有哪些可用选项？

Answer 1

我没试过，但是这里有一个可能的解决方案：https://bookdown.org/yihui/bookdown/a-single-document.html

特别是，在您的 YAML 元数据中指定：

output:
  bookdown::pdf_book:
    base_format: rticles::elsevier_article

Answer 2

由于我是使用R Markdown 的新手，因此我决定发布此答案，因为有些人可能会犯同样的错误。我自己尝试过 F Rodriguez-Sanchez 的答案，但没有奏效。我收到以下消息：

! LaTeX Error: File `elsarticle.cls' not found.

! Emergency stop.
<read *> 

Erro: Failed to compile report.tex. See report.log for more info.

它不起作用，因为我尝试添加建议的答案，选择New Markdown，然后选择Document，因此犯了一个新手错误。

然后我尝试打开一个New R Markdown，从rticles 包中选择From Template 和Elsevier Journal Article。在那之后，我使用了 F Rodriguez-Sanchez 建议的答案，并且成功了！

最终的 yaml 标头是：

---
title: Short Paper
author:
  - name: Alice Anonymous
    email: alice@example.com
    affiliation: Some Institute of Technology
    footnote: Corresponding Author
  - name: Bob Security
    email: bob@example.com
    affiliation: Another University
address:
  - code: Some Institute of Technology
    address: Department, Street, City, State, Zip
  - code: Another University
    address: Department, Street, City, State, Zip
abstract: |
  This is the abstract.

  It consists of two paragraphs.

journal: "An awesome journal"
date: "`r Sys.Date()`"
bibliography: mybibfile.bib
output:
  bookdown::pdf_book:
    base_format: rticles::elsevier_article
---

Answer 3

@maycca 请确保通过从模板中选择新文件并选择 Elsevier Journal 版本/模板来打开 RMarkdown。模板将在文章安装后可用。

这将设置文章“基础设施”（特别是相应的 cls 和其他文件）。这还包括一个 mybibfile.bib 示例（因此，我不需要将 biblio 注释掉）。 如果您选择将其保存在子文件夹中，请确保您的 Rmd 文件保存在该子文件夹中。

如上/下所示，更改 YAML 的 output: 标记以包含 bookdown 和基本格式 rticles::elsevier_article 指针。
仔细检查冒号和制表符的使用。

根据上面的示例，您可以使用 bookdown 交叉引用，如下所示。我用过
(i) 在代码块之前使用(ref:awesomeplotcaption) 定义的外部（bookdown）图形标题。这对于保持块选项简短（呃）很有用。
(ii) 对图\@ref(fig:awesomeplot) 的（书本）交叉引用。请注意\@ref(fig:...) 使用块名称来使指针工作。因此，请确保您的块名称带有标准字母、数字和破折号，即没有下划线！

点击编织按钮会变魔术！

---
title: Short Paper
author:
  - name: Alice Anonymous
    email: alice@example.com
    affiliation: Some Institute of Technology
    footnote: Corresponding Author
  - name: Bob Security
    email: bob@example.com
    affiliation: Another University
address:
  - code: Some Institute of Technology
    address: Department, Street, City, State, Zip
  - code: Another University
    address: Department, Street, City, State, Zip
abstract: |
  This is the abstract.

  It consists of two paragraphs.

journal: "An awesome journal"
date: "`r Sys.Date()`"
#bibliography: mybibfile.bib
output:
  bookdown::pdf_book:
    base_format: rticles::elsevier_article
---

# First Heading

Some cool introductory text.

And an even more fascinating plot.

(ref:awesomeplotcaption) A simple demo plot

```{r awesomeplot, fig.cap="(ref:awesomeplotcaption)"}
x <- -5:5
y <- x^2

plot(x,y)
```

More explanatory text.

Using bookdown cross-referencing, have again a closer look at Fig. \@ref(fig:awesomeplot).

这会导致以下结果：

附：关注交叉引用并忽略代码块，这可以用echo = FALSE 隐藏。如下图（在本例中，通过 LATEX 放置）。我将其截断以保持图形易于管理:)