R 的保留内存是已分配数组大小的两倍

【问题标题】：Reserved memory of R is twice the size of an allocated arrayR 的保留内存是已分配数组大小的两倍
【发布时间】：2012-07-26 08:03:33
【问题描述】：

我发现了以下行为。假设我创建了以下多维数组：

spam = array(runif(96*48*60*360), dim = c(96,48,60,360))

R 应该为此使用多少内存是完全可以预测的，即 (96*48*60*360) * 4 字节 = 759.4 Mbyte。使用lsos 函数很好地证实了这一点（参见this post）：

> lsos()
         Type      Size PrettySize Rows Columns
spam    array 796262520   759.4 Mb   96      48
lsos function       776  776 bytes   NA      NA

R 作为一个进程但是使用更多的内存，大约是大小的两倍：

$ top | grep rsession
82:17628 hiemstra  20   0 1614m **1.5g** 8996 S  0.3 40.4   0:04.85 rsession

为什么 R 会这样做？我假设分配额外的保留内存是为了让 R 可以更快地访问它？有什么想法吗？

【问题讨论】：

标签： r memory-management

【解决方案1】：

因为垃圾收集器还没有运行。
所以有很多垃圾，可能是在创建大数组的过程中产生的，需要清除。

如果您通过调用gc() 函数强制进行垃圾回收，您会看到已使用的内存将非常接近您的数组大小：

> memory.size()
[1] 775.96

【讨论】：

所以最终数组使用了 759.4 MB，但是在创建过程中它使用了更多？如果数组适合内存，那可能会很不幸，但创建期间内存使用量的峰值使用的内存量超过了可用内存量。
好吧，我不知道幕后到底发生了什么，但是使用您的代码，您不仅仅是分配一个数组；实际上，首先生成一个随机数向量，然后通过复制该值来分配一个数组。所以，我猜大部分开销（即垃圾）是由于那个一次性向量......
但是，我猜垃圾收集器会在内存不足时自动触发，所以我认为只要数组适合内存，这不会是性能问题......跨度>