使用 R 包装器时，R 垃圾收集器是否会释放 C 中分配的内存？答案

【问题标题】：Does R garbage collector frees memory allocated in C when using a R wrapper?使用 R 包装器时，R 垃圾收集器是否会释放 C 中分配的内存？
【发布时间】：2015-06-01 16:04:15
【问题描述】：

我正在为 C 代码使用 R 包装器。在小运行中，一切似乎都很好，但我在这个周末进行了更长的分析，我得到了我认为是内存泄漏的问题。我收到了消息：

Mac OS X 启动盘没有更多空间可用于应用程序内存，我不得不重新启动机器。

我假设我理解正确并且我有内存泄漏。了解 R 和 C 如何管理内存将帮助我了解内存泄漏在哪里。我的问题是：

当指针被发送回 R 时，在 C 运行期间分配的内存会发生什么情况？这些内存是由 R 垃圾收集器释放的，还是确保直接释放 C 中的所有内存非常重要？

编辑

在 R 中直接分配了一些内存空间并传递给 C。这些是之后返回给 R 的变量，我怀疑 R 垃圾收集器会正确管理这些内存。我怀疑可能导致内存泄漏的变量是临时变量，在 C 中使用 malloc 或 calloc 分配内存并且不会返回给 R。

【问题讨论】：

您的问题的答案取决于您如何分配内存，我怀疑您的问题的答案在Writing R Extensions, Section 5.9.2 - Allocating Storage 或Section 6.1 - Memory Allocation 中。
我还没有检查你的链接。我试图在编辑中解决您的评论。谢谢

标签： c r memory memory-leaks

【解决方案1】：

R 垃圾收集器不会自动调用 C 的 free，除非你告诉它。

例如，如果你有一个 C 函数，我们称它为“分配器”，它返回一个带有相关内存的指针：

varA <- .Call("allocator", 1000)  #Allocate 1000 bytes
doProcess(varA) #...

varA <- .Call("allocator", 1000)  #Allocate 1000 bytes again
 #varA is overwritten, so R is going to try to call the object destructor

问题是“分配器”对象没有定义析构函数。方法是：

varA <- .Call("allocator", 1000)  #Allocate 1000 bytes
#let's tell R what to do in the garbage collection process:
reg.finalizer(varA, function(x){
                      .Call("deAllocator", x)
                      })
doProcess(varA) #...

varA <- .Call("allocator", 1000) #Allocate 1000 bytes again
#varA is overwritten, so R is going to call "deAllocator"

“deAllocator”函数必须在 C 中定义，它应该从指针中释放内存。

【讨论】：