R：导入data.table包命名空间，内存消耗莫名其妙的跳跃

Question

我在自己的包中使用 data.table 包，并在 NAMESPACE 和 DESCRIPTION 文件中导入 data.table 命名空间。 在我的一个函数中，我使用 data.table 函数将 data.frame 转换为 data.table

dt <- data.table(df)

但是当我调用我的函数时，在调用 data.table() 时，内存使用量会立即跳跃，而 R 会停止响应。 当我逐行运行并且内存消耗低时，函数中的代码运行良好。 另外，如果我将 library(data.table) 放在我的函数中，一切都很好。我试图避免将 library(data.table) 放在我的函数中，而是声明依赖关系。但是，这种方式似乎出了点问题。我在 Mac OS X 10.6.8 上运行 R-2.14.0

谁能解释可能是什么原因，我该如何解决（不在我的函数中使用 library(data.table)）？

Answer 1

一些没有特定顺序的随机猜测：

尝试仅在说明中使用 Imports 或 Depends 字段。我认为您也不需要在 NAMESPACE 中导入，但我可能错了。为什么这可以解释内存使用，但不知道。

df 是什么？它是大的还是以某种方式递归或奇怪的？如果可能，请提供str(df) 告诉我们一些相关信息。

试试as.data.table(df)，它比data.table(df) 快。但是听起来您的问题与此不同。

您的函数调用是否被重复调用？我明白为什么反复将df 转换为dt 会耗尽内存，但不明白为什么只调用library(data.table) 会那么快。

尝试使用R --vanilla 启动R，以确保在启动时不加载.Rdata（其中可能包括屏蔽data.table 的函数）等。如果您已经开发了自己的包，那么某种函数名称冲突，或者search() 路径上的包顺序听起来很合理。

否则，我们将需要更多信息。我不记得有任何类似的事情发生在我身上，或者之前被报道过。

还有，您使用的是哪个版本的data.table？在 R-Forge 上的 v1.8.1 中有这个错误修复（还没有在 CRAN 上）：

• 将data.table 设置代码从.onAttach 移至.onLoad，以便当data.table 只是从包中的imported 时也运行它，修复与缺少data.table 选项相关的#1916。

但是，如果您使用的是 CRAN 的 1.8.0，并且正在导入（仅）而不是依赖，那么我希望您会收到有关缺少选项的错误，而不是内存消耗的跳跃。