knitr、lavaan 和下标越界答案

【问题标题】：knitr, lavaan, and subscript out of boundsknitr、lavaan 和下标越界
【发布时间】：2013-10-19 18:32:17
【问题描述】：

我收到一个错误，Error in lines[[i]] : subscript out of bounds，当我尝试编织一个从外部文件读取模型然后将模型拟合到 lavaan 中的块时。

我在.R 文件中创建模型：

model <- readLines(con = textConnection('
  depression =~ thoughts + pain + brain + use + suic + talk + sitalone +         
                headaches + app + heart + cheek + cry + sleep + disob + cold +
                liedown + worries + alone + annoyed + holdhead + drinkal +
                insult + greet + think + mutter + trust + donoth + sad + bad +
                weak + notalk + forget + crycont + livedie
  '))

cat(model, file = 'scripts/mod.lav.f1.0', sep = '\n')

运行.R 文件时，它会将以下内容放入scripts/mod.lav.f1.0 文件中：

depression =~ thoughts + pain + brain + use + suic + talk + sitalone +         
              headaches + app + heart + cheek + cry + sleep + disob + cold +
              liedown + worries + alone + annoyed + holdhead + drinkal +
              insult + greet + think + mutter + trust + donoth + sad + bad +
              weak + notalk + forget + crycont + livedie

然后我的.rnw 文件读入指定我的模型的scripts/mod.lav.f1.0。

\documentclass{article}

\begin{document}

<<cfa, include=FALSE, tidy=FALSE>>=
# read in model from file
 mod.1f.0 <- readLines("scripts/mod.lav.f1.0")
# fit the model
 fit.1f.0 <- cfa(mod.1f.0, data = mydata, ordered=items)
@

\end{document}

块中有问题的语句似乎是fit.1f.0 <- cfa(mod.1f.0, data = mydata, ordered=items)。编织文档时，出现错误：Error in lines[[i]] : subscript out of bounds。

我可以在R 中运行该块而没有任何问题。模型存储在mod.1f.0，拟合存储在fit.1f.0。

对导致此错误的原因有什么想法吗？

【问题讨论】：

我们不知道mydata 或items 是什么，所以这不是一个可重复的例子。你能提供一个最小的独立的例子吗？您也可以在错误发生后在 R 会话中提供library(knitr); sessionInfo() 和traceback()。
谢谢@Yihui。有人给我发了另一个我能够运行的示例，所以我决定删除我的缓存和 RStudio 创建的所有隐藏项目文件。有效。在这样做之前，我只尝试过重新启动 RStudio。我会关闭这个问题。

标签： r knitr r-lavaan

【解决方案1】：

有人给我发了另一个我能够运行的示例，所以我决定删除我的缓存以及 RStudio 创建的所有隐藏项目文件。有效。在此之前，我只尝试重新启动 RStudio。

【讨论】：