R Markdown / rmarkdown (html/pdf) 中的回归表

Question

出于发布的目的，我经常需要我的作品的 PDF 和 HTML 版本，包括回归表，我想使用 R Markdown。对于 PDF，stargazer 和 texreg 包可以生成精美的表格。现在尝试生成同样吸引人的 HTML 输出，我面临着不同的问题。

1. 两种 HTML 输出方法在注释中缺少重要星标。由于它们是自动生成的，我不知道如何逃避它们。 （我认为这可能是一个小问题，因此我不想将其拆分为单独的问题。） 注意：子问题已得到回答here.

2. 在创建明确的输出之前，我经常需要更改我的数据或进行一些格式化。我发现总是手动切换type='html' 到type='pdf' 之间的选项很烦人。我想知道是否有更可行的方法来组合 html/pdf 输出，例如texreg / stargazer 中的个案切换，输出整齐？

我尝试了有前途的pander-solution，但它似乎自 2014 年以来不再有效。另外，pixiedust 也不是很令人满意，它最终变得有点手动，而不是我想要的。 An other example 似乎只指普通表。

非常感谢任何帮助，谢谢！

以下是我在 HTML 和 PDF 中对knitr 的尝试总结：

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```
```{r table, results = "asis"}
library(car)
lm1 <- lm(prestige ~ income + education, data=Duncan)

## html
# stargazer
library(stargazer)
stargazer(lm1, type="html", notes="stargazer html")
# htmlreg
library(texreg)
htmlreg(lm1, custom.note="%stars. htmlreg")

## pdf/latex
# stargazer
stargazer(lm1, notes="stargazer latex")
# texreg
texreg::texreg(list(lm1), custom.note="%stars. texreg")

# pixiedust
library(pixiedust)
dust(lm1, caption = "pixiedust")

# pander
library(memisc)
library(pander)
lm1_table <- mtable(lm1)
# pander(lm1_table, style="rmarkdown") # not working
pander(lm1)
```

Answer 1

这是一个命题：创建一个检查输出格式的函数，然后根据此使用 stargazer 或 texreg。我们使用opts_knit$get("rmarkdown.pandoc.to") 来检查输出格式。

---
output: html_document
---

```{r setup, include=FALSE}
library(knitr)
opts_chunk$set(echo = TRUE)
rmd_format <- opts_knit$get("rmarkdown.pandoc.to")
## returns "html" or "latex"

```

```{r}

report_regression <- function(model, format, ...){
  if(format == "html"){
    require(texreg)
    htmlreg(model, custom.note="%stars. htmlreg", ...)
  } else if(format == "latex"){
    require(stargazer)
    stargazer(model, notes="stargazer html", ...)
  } else {
   print("This only works with latex and html output") 
  }
}
```

```{r table, results = "asis"}
library(car)
lm1 <- lm(prestige ~ income + education, data=Duncan)

report_regression(lm1, format = rmd_format)
```

Answer 2

如指出in an answer to a related question, knitr 1.18 introduced 以下函数

knitr::is_html_output()
knitr::is_latex_output()

检查输出是 HTML 还是 LaTeX。改编@scoa 的优秀答案：

---
output: html_document
---

```{r}

report_regression <- function(model, ...){
  if(knitr::is_html_output()){
    require(texreg)
    htmlreg(model, custom.note="%stars. htmlreg", ...)
  } else if(knitr::is_latex_output()){
    require(stargazer)
    stargazer(model, notes="stargazer html", ...)
  } else {
   print("This only works with latex and html output") 
  }
}
```

```{r table, results = "asis"}
library(car)
lm1 <- lm(prestige ~ income + education, data=Duncan)

report_regression(lm1)
```