在 MATLAB 中将数据保存到 .mat 文件

Question

我是 MATLAB 新手，我无法让我的函数工作以将我的数据保存到 .mat 文件中。

输入：

• 一个结构，有 5 个字段：

  • data：19x1000x143 的 3D 矩阵
  • labels：1x143 矩阵，其中包含 1 或 -1
  • subject_number：一个整数
  • sampling_rate：整数，500Hz
  • channel_names: 1x19 矩阵，其中包含文本

• name：文件名字符串

• clean：一个 1x143 的矩阵，其中包含 1 或 0。

这个想法是只保存干净的数据，在干净的矩阵中标记为1。

 If clean(i) is equal to 1:
      save data(:,:,i) and labels(:,i)

这是我尝试在 save.m 文件中实现的代码：

function saving(EEG_struct, clean, name)

subject_number = EEG_struct.subject_number;
fs = EEG_struct.sampling_rate;
chan_names = EEG_struct.channel_names;
nb_epoch = size(EEG_struct.data, 3);

for j=1:nb_epoch
    if clean(j) == 1
        % Keep the epoch and label
        data = cat(3, data, EEG_struct.data(:,:,j));
        labels = cat(2, labels, EEG_struct.labels(:,j));
    end
end

save(name, data, labels, subject_number, fs, chan_names)

如您所见，我想将数据保存为与EEG_struct 输入具有相同形状的结构。 此外，我想使用 parfor 而不是 for，但它给我带来了一个我不太明白的错误：

An UndefinedFunction error was thrown on the workers for 'data'.  This might be because the file containing 'data' is not accessible on the workers.  Use addAttachedFiles(pool, files) to specify the required files to be attached.  See the documentation for 'parallel.Pool/addAttachedFiles' for more details. Caused by: Undefined function or variable 'data'.

感谢您的帮助！

Answer 1

您可以使用clean 变量作为逻辑索引，并一次性解析出数据和标签。所以不需要循环。

save 命令也需要变量的“名称”来保存变量本身。所以我只是在每一个周围加上''。

function saving(EEG_struct, clean, name)

subject_number = EEG_struct.subject_number;
fs = EEG_struct.sampling_rate;
chan_names = EEG_struct.channel_names;
nb_epoch = size(EEG_struct.data, 3);

%No need for a loop at all
data  = EEG_struct.data(:,:,logical(clean));
labels = EEG_struct.labels(logical(clean));  %This is a 1xN so I removed the extra colon operator
save(name, 'data', 'labels', 'subject_number', 'fs', 'chan_names');

编辑： 如果您只想将所有内容留在结构中，请根据您的评论。我给了你 2 个关于如何保存它的选项。

function saving(EEG_struct, clean, name)
%Crop out ~clead data
EEG_struct.data  = EEG_struct.data(:,:,logical(clean));
EEG_struct.labels = EEG_struct.labels(logical(clean));  %This is a 1xN so I removed the extra colon operator
% Option 1
save(name, 'EEG_struct'); 
% Option2
save(name, '-struct', 'EEG_struct');

选项 1 会将结构体直接保存到 MAT 文件中。因此，如果您要像这样加载数据：

test = load(name);

test = 
        EEG_struct: [1x1 struct]

您会将您的结构放置在另一个结构中......这可能不理想或需要额外的线来取消嵌套。另一方面，仅加载没有输出的 MAT 文件 load(name) 会将 EEG_struct 放入当前工作区。但是如果在一个函数中，那么它就会在没有被声明的情况下突然出现，这使得代码更难遵循。

选项 2 使用“-struct”选项自动将每个字段拆分为 MAT 文件中的单独变量。所以像这样加载：

EEG_struct = load(name);

将所有字段重新组合在一起。对我来说，至少在函数中完成这看起来更干净，但可能只是我的偏好

所以注释掉你喜欢哪个。另外，不是我没有在保存中包含clean。您可以将其附加到 MAT 或将其添加到您的结构中。

Answer 2

要获得与EEG_struct 相同但只有与clean 变量对应的数据/标签的结构，您可以简单地复制现有结构并删除clean=0 所在的行

function saving(EEG_struct, clean, name)

newstruct = EEG_struct;
newstruct.data(:,:,logical(~clean)) = '';
newstruct.labels(logical(~clean)) = '';

save(name,'newstruct');