使用 mongo.bson.from.list() 和 $or 表达式从 R 查询 MongoDB答案

【问题标题】：Query MongoDB from R with mongo.bson.from.list() and $or expression使用 mongo.bson.from.list() 和 $or 表达式从 R 查询 MongoDB
【发布时间】：2014-08-08 15:03:09
【问题描述】：

test.xxx的内容：

> use test
switched to db test
> db.xxx.find()
{ "_id" : ObjectId("53e4e4983f6dc95697944b74"), "a" : 1 }
{ "_id" : ObjectId("53e4e49a3f6dc95697944b75"), "a" : 2 }
{ "_id" : ObjectId("53e4e49c3f6dc95697944b76"), "a" : 3 }

R 会话：

> library(rmongodb)
> M <- mongo.create("localhost")
> mongo.is.connected(M)
[1] TRUE
> 
> qry1 <- list(
+     "a" = 1
+ )
> 
> qry2 <- list(
+     "$or" = list(
+         list("a" = 1),
+         list("a" = 3)
+     )
+ )
> 
> qry1 <- mongo.bson.from.list(qry1)
> qry2 <- mongo.bson.from.list(qry2)
> 
> mongo.count(M, "test.xxx", qry1)
[1] 1
> mongo.count(M, "test.xxx", qry2)
[1] -1
> mongo.get.last.err(M, "test")
    connectionId : 16    24
    err : 2      $or needs an array
    code : 16    2
    n : 16   0
    ok : 1   1.000000

qry2 的结果应该是 2。

我必须如何改写qry2 的列表？

我特别想使用 mongo.bson.from.list() 而不是 mongo.bson.from.json() 或从“缓冲区”构建 BSON 的替代方法。

请注意，以下三个问题涉及 $or 但不涉及从 list() 创建 BSON：

【问题讨论】：

这是 rmongodb 中的一个错误。不幸的是，目前没有可用的解决方案。请检查此替代方案：stackoverflow.com/questions/12067020/rmongodb-using-or-in-query
我成功地实现了使用缓冲区的替代方法——这有点乏味。我希望这个错误可能会因为它的高龄而得到修复。我正在使用你的（除了这个非常棒的错误）包作为原型。 R 需要一个与 MongoDB 的良好接口 - rmongodb 是目前最好的选择。所以我——以及世界上成千上万的其他 R 开发者——希望它能够得到积极的维护。肯定会花时间调查这个错误 - 只是我在 C 编程方面没有值得提及的经验。
现在这行得通了！从 github 尝试最新版本的 rmongodb。感谢来自Jeroen Ooms的pull

标签： r mongodb rmongodb

【解决方案1】：

为了避免编写 mongo.bson.buffer-statements 的序列，我编写了一个包 (rmongodbHelper)，它将 JSON 或 list() 转换为 BSON 对象，然后可以与 rmongodb 一起使用。

首先让我们设置环境：

library(rmongodb)

# install rmongodbHelper package from GitHub

library(devtools)
devtools::install_github("joyofdata/rmongodbHelper")
library(rmongodbHelper)

# the MongoDB instance

ns <- "dbx.collx"
M <- mongo.create()
mongo.is.connected(M)
mongo.remove(M, ns, json_to_bson("{}"))

# inserting a number of dummy objects
# JSON keys currently are expected to be wrapped in double quotes!

objs <- c(
  '{"a":"__int(1)"}',
  '{"a":"__int(2)"}',
  '{"a":"__int(3)"}'
)

for(obj in objs) {
  mongo.insert(M, ns, json_to_bson(obj))
}

让我们通过 MongoDB shell 看看它们是否插入成功：

> use dbx
switched to db dbx
> db.collx.find().pretty()
{ "_id" : ObjectId("53fa14315aed8483db4ae794"), "a" : 1 }
{ "_id" : ObjectId("53fa14315aed8483db4ae795"), "a" : 2 }
{ "_id" : ObjectId("53fa14315aed8483db4ae796"), "a" : 3 }

现在让我们搜索一个等于 1：

# searching for those objects
# JSON keys currently are expected to be wrapped in double quotes!

json_qry <- '{"a":1}'

cur <- mongo.find(M, "dbx.collx", json_to_bson(json_qry))

while(mongo.cursor.next(cur)) {
  print(mongo.cursor.value(cur))
}

这就是我们得到的：

_id : 7      53fa14315aed8483db4ae794
a : 16   1

最后让我们搜索一个等于 1 或 3：

json_qry <- 
'{
  "$or": [
    {"a":1},
    {"a":3}
  ]
}'

cur <- mongo.find(M, "dbx.collx", json_to_bson(json_qry))

while(mongo.cursor.next(cur)) {
    print(mongo.cursor.value(cur))
}

及其结果：

_id : 7      53fa14315aed8483db4ae794
a : 16   1
_id : 7      53fa14315aed8483db4ae796
a : 16   3

键 - 也像 $or 这样的运算符 - 需要放在双引号中。
"x":3 将导致 3 被转换为 double
"x":"__int(3)" 将导致 3 被转换为整数

这是使用缓冲区的解决方法：

M <- mongo.create("localhost")
mongo.is.connected(M)

buf <- mongo.bson.buffer.create()

# "$or":[ ...
mongo.bson.buffer.start.array(buf, "$or")

# dummy name "0" for object in array
# "0": { ...
mongo.bson.buffer.start.object(buf, "0")
# "a":1
mongo.bson.buffer.append.int(buf, "a", 1)
# ... }
mongo.bson.buffer.finish.object(buf)

mongo.bson.buffer.start.object(buf, "1")
mongo.bson.buffer.append.int(buf, "a", 3)
mongo.bson.buffer.finish.object(buf)

# ...]
mongo.bson.buffer.finish.object(buf)

q <- mongo.bson.from.buffer(buf)

mongo.count(M, "test.xxx", q)

【讨论】：