【发布时间】:2020-12-26 16:58:55
【问题描述】:
在 Rcpp 中编写一个用于按列计算样本偏度的函数我在使用 sqrt() 函数时遇到了麻烦。我知道 sqrt(x) 适用于 NumericVector 类型(在单独的文件中对其进行了测试),但是在我的代码中(我试图传递双打)它不起作用。
这是我的代码:
#include <Rcpp.h>
#include <cmath>
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
NumericVector colSkew(NumericMatrix x) {
int nc = x.ncol();
int nr = x.nrow();
NumericVector colS(nc);
for(int i = 0; i < nc; i++){
double cMean = mean(x( _ ,i));
double xSq = 0;
double cSt = 0;
for(int j = 0; j < nr; j++){
xSq += std::pow(x(j,i), 2.0);
cSt += std::pow(x(j,i) - cMean, 3.0);
}
double colMsq = nr * std::pow(cMean, 2.0);
double cTT = sqrt((xSq - colMsq)) / (nr - 1);
double colVar = cTT / (nr - 1);
double colNew = nr * std::pow(colVar, 3);
colS[i] = cSt / colNew;
}
return(colS);
}
我尝试了std::sqrt(),却给了我“对 sqrt 的调用不明确”的错误。对于那个,既不是Getting: error C2668: 'sqrt' : ambiguous call to overloaded function,也不是http://dirk.eddelbuettel.com/code/rcpp.examples.html的
inline static double sqrt_double( double x ){ return ::sqrt( x ); }
帮助。 (后者本身有“无匹配功能”或“模棱两可”的问题)。 代码本身可以编译,但不能正常工作(我可以调用函数但结果不好)。
可重现的例子:
# First load the cpp function, however you want to;
Create example data:
A = matrix(rchisq(1000, 5), nrow = 100)
library(timeDate)
skew.1 = apply(A, 2, skewness)
skew.2 = colSkew(A)
# A custom R-function which should mimic the cpp function
colSkew.r = function(x){
nc = ncol(x)
nr = nrow(x)
colS = numeric(nc)
cMean = colMeans(x)
xSq = colSums(x^2)
cSt = 0
for(i in 1:nc){
cSt = sum((x[,i]-cMean[i])^3)
colMsq = nr * cMean[i]^2
cTT = sqrt((xSq[i] - colMsq) / (nr - 1))
colNew = nr * cTT^3
colS[i] = cSt / colNew
}
return(colS)
}
skew.3 = colSkew.r(A)
【问题讨论】:
-
编译器是否列出了它认为可以匹配您的调用但无法消除歧义的
sqrt的重载? “Rcpp.h”是否包含sqrt函数? -
如果问题不在于编译,您能否添加一个小示例数据以使用该功能,以及该小示例的当前和所需输出?谢谢!有关详细信息,请参阅minimal reproducible example。我怀疑将
(nr - 1)更改为(nr - 1.0)会有所帮助,但需要一个示例来确定 -
这里唯一可能的答案是 Rcpp 的 sqrt 版本会导致重载解决问题。预处理文件并查找
sqrt的所有声明以找出它的来源。删除using namespace Rcpp;也可能有所帮助。 -
或者不要删除它并执行
std::sqrt -
是的,伙计们,非常感谢你们的工作,错误是该死的支架设置错误。 :(