【发布时间】:2017-04-28 01:39:01
【问题描述】:
我正在尝试模拟一组神经元的平均行为。这意味着我需要对包含数十亿个元素的矩阵进行计算(steps~106、neurons~10 4)。
为了避免吃掉我的整个 RAM(并死去尝试),我决定在完成计算后立即从矩阵中删除行。我对 C++ 没有太多经验,但我的理解是 v.erase( v.begin()-i+1); 应该允许我这样做。
// Membrane potential matrix using st::vector
vector<vector<double>> v;
v.resize(steps + 1, vector<double>(neurons));
// Initialise v
for (size_t n = 0; n < neurons; n++) {
v[0][n] = v0;
}
double v_avg[steps + 1] = {v0};
// Loop
for (size_t i = 1; i < steps + 1; i++) {
for (size_t n = 0; n < neurons; n++) {
if(v[i-1][n] >= vp) {
v[i][n] = -vp;
}
else {
v[i][n] = v[i-1][n] + h * ( pow(v[i-1][n], 2) + I[i] + eta[n] );
}
v_avg[i] += v[i][n]; // Sum of membrane potentials
}
cout << "step " << i << "/" << steps << " done\n";
v.erase( v.begin()-i+1); // Erase row v[i-1]
v_avg[i] = v_avg[i]/neurons; // Mean membrane potential
}
v.erase( v.begin()+steps+1 ); // Erase last row
我不确定为什么在 steps/2 步骤之后会出现分段错误(我正在使用较小的 steps 值进行测试):
...
step 10/20 done
[1] 1791 segmentation fault (core dumped) ./qif_solve_vect
更新:
感谢@1201ProgramAlarm 我明白了我的问题所在。我的问题是:
- 如何以从一开始就没有分配的方式使用矩阵。
- 如何在保留索引的同时释放/释放行(与
v.erase( v.begin())不同)。这是必不可少的,因为稍后我将在每个神经元产生尖峰时为它们实现不同的不应时间 (v[i][n] = -vp;)。
【问题讨论】:
标签: c++ matrix vector segmentation-fault