为什么在 Rcpp 中使用“pnorm”时出现错误

Question

我需要在我的 Rcpp 代码中包含来自 arma:: 的变量。但是我在尝试使用糖函数pnorm 时遇到了问题。这是一个演示：

#include <RcppArmadillo.h>
#include <RcppArmadilloExtensions/sample.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::export]]
double pget(NumericVector x, NumericVector beta) {
  arma::colvec xx = Rcpp::as<arma::colvec>(x) ;
  arma::colvec bb = Rcpp::as<arma::colvec>(beta) ;
  double tt = as_scalar( arma::trans(xx) * bb);
  double temp = Rcpp::pnorm(tt);
  return temp;
}

然后报错：no matching function for call to 'pnorm5'

这是否意味着我不能使用Rcpp::pnorm???

Answer 1

Rcpp 糖函数适用于矢量类型参数，例如Rcpp::NumericVector。对于标量参数，您可以使用 R 命名空间中的函数：

#include <RcppArmadillo.h>
#include <RcppArmadilloExtensions/sample.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::export]]
double pget(NumericVector x, NumericVector beta) {
  arma::colvec xx = Rcpp::as<arma::colvec>(x) ;
  arma::colvec bb = Rcpp::as<arma::colvec>(beta) ;
  double tt = as_scalar( arma::trans(xx) * bb);
  double temp = R::pnorm(tt, 0.0, 1.0, 1, 0);
  return temp;
}

/*** R
x <- rnorm(5)
beta <- rnorm(5)
pget(x, beta)
*/

顺便说一句，这里有两种变体。第一个变体使用arma 而不是Rcpp 向量作为参数。由于这些是const 引用，因此不会复制任何数据。另外，使用arma::dot：

// [[Rcpp::export]]
double pget2(const arma::colvec& xx, const arma::colvec& bb) {
  double tt = arma::dot(xx, bb);
  return R::pnorm(tt, 0.0, 1.0, 1, 0);
}

第二个变体计算标量积而不使用犰狳：

// [[Rcpp::export]]
double pget3(NumericVector x, NumericVector beta) {
  double tt = Rcpp::sum(x * beta);
  return R::pnorm(tt, 0.0, 1.0, 1, 0);
}

Answer 2

我比 Rcpp 的 @RalfStubner 更不是专家，所以我不得不四处寻找（在 StackOverflow 和 Rcpp cheat sheat 的帮助下）来获取以下代码。我没有在标量上使用 R 命名空间版本，而是转换回 NumericVector ......这几乎可以肯定地由真正知道自己在做什么的人更有效地完成/跳过几步......例如有可能不经过as_scalar 就可以直接完成 arma 到 NumericVector 的转换...？

#include <RcppArmadillo.h>
#include <RcppArmadilloExtensions/sample.h>
#include <Rcpp.h>

// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
using namespace Rcpp;
using namespace arma;

// [[Rcpp::export]]
NumericVector pget(NumericVector x, NumericVector beta) {
  colvec xx = as<colvec>(x) ;
  colvec bb = as<colvec>(beta) ;
  double tt = as_scalar(trans(xx) * bb);
  NumericVector tt2 = NumericVector::create( tt );
  NumericVector temp = Rcpp::pnorm(tt2);
  return temp;
}